Protein–RNA interactions for Protein: Q99J19

Smim11a, Small integral membrane protein 11A, mousemouse

Predictions only

Length 55 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim11aQ99J19 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Smim11aQ99J19 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Smim11aQ99J19 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Smim11aQ99J19 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Smim11aQ99J19 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Smim11aQ99J19 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Smim11aQ99J19 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Smim11aQ99J19 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Smim11aQ99J19 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Smim11aQ99J19 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Smim11aQ99J19 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Smim11aQ99J19 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Smim11aQ99J19 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Smim11aQ99J19 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Smim11aQ99J19 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Smim11aQ99J19 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Smim11aQ99J19 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Smim11aQ99J19 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Smim11aQ99J19 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Smim11aQ99J19 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Smim11aQ99J19 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Smim11aQ99J19 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Smim11aQ99J19 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Smim11aQ99J19 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Smim11aQ99J19 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Smim11aQ99J19 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Smim11aQ99J19 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Smim11aQ99J19 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Smim11aQ99J19 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Smim11aQ99J19 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Smim11aQ99J19 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Smim11aQ99J19 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Smim11aQ99J19 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Smim11aQ99J19 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Smim11aQ99J19 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Smim11aQ99J19 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Smim11aQ99J19 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Smim11aQ99J19 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Smim11aQ99J19 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Smim11aQ99J19 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Smim11aQ99J19 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Smim11aQ99J19 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Smim11aQ99J19 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Smim11aQ99J19 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Smim11aQ99J19 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Smim11aQ99J19 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Smim11aQ99J19 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Smim11aQ99J19 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Smim11aQ99J19 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Smim11aQ99J19 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Smim11aQ99J19 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Smim11aQ99J19 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Smim11aQ99J19 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Smim11aQ99J19 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Smim11aQ99J19 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Smim11aQ99J19 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Smim11aQ99J19 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Smim11aQ99J19 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Smim11aQ99J19 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Smim11aQ99J19 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Smim11aQ99J19 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Smim11aQ99J19 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Smim11aQ99J19 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Smim11aQ99J19 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Smim11aQ99J19 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Smim11aQ99J19 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Smim11aQ99J19 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Smim11aQ99J19 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Smim11aQ99J19 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Smim11aQ99J19 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Smim11aQ99J19 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Smim11aQ99J19 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Smim11aQ99J19 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Smim11aQ99J19 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Smim11aQ99J19 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Smim11aQ99J19 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Smim11aQ99J19 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Smim11aQ99J19 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Smim11aQ99J19 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Smim11aQ99J19 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Smim11aQ99J19 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Smim11aQ99J19 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Smim11aQ99J19 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Smim11aQ99J19 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Smim11aQ99J19 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Smim11aQ99J19 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Smim11aQ99J19 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Smim11aQ99J19 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Smim11aQ99J19 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Smim11aQ99J19 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Smim11aQ99J19 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Smim11aQ99J19 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Smim11aQ99J19 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Smim11aQ99J19 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Smim11aQ99J19 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Smim11aQ99J19 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Smim11aQ99J19 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Smim11aQ99J19 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Smim11aQ99J19 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Smim11aQ99J19 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.4 ms