Protein–RNA interactions for Protein: Q924C5

Alpk3, Alpha-protein kinase 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,678 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alpk3Q924C5 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
Alpk3Q924C5 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
Alpk3Q924C5 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.55■■■■□ 3.12
Alpk3Q924C5 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
Alpk3Q924C5 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC34.53■■■■□ 3.12
Alpk3Q924C5 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
Alpk3Q924C5 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC34.53■■■■□ 3.12
Alpk3Q924C5 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.52■■■■□ 3.12
Alpk3Q924C5 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.51■■■■□ 3.12
Alpk3Q924C5 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC34.51■■■■□ 3.12
Alpk3Q924C5 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
Alpk3Q924C5 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC34.5■■■■□ 3.11
Alpk3Q924C5 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC34.49■■■■□ 3.11
Alpk3Q924C5 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
Alpk3Q924C5 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC34.48■■■■□ 3.11
Alpk3Q924C5 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC34.47■■■■□ 3.11
Alpk3Q924C5 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
Alpk3Q924C5 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC34.45■■■■□ 3.11
Alpk3Q924C5 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.44■■■■□ 3.1
Alpk3Q924C5 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
Alpk3Q924C5 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
Alpk3Q924C5 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
Alpk3Q924C5 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC34.44■■■■□ 3.1
Alpk3Q924C5 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
Alpk3Q924C5 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
Alpk3Q924C5 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC34.43■■■■□ 3.1
Alpk3Q924C5 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
Alpk3Q924C5 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC34.42■■■■□ 3.1
Alpk3Q924C5 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
Alpk3Q924C5 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
Alpk3Q924C5 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
Alpk3Q924C5 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC34.41■■■■□ 3.1
Alpk3Q924C5 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC34.41■■■■□ 3.1
Alpk3Q924C5 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Alpk3Q924C5 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC34.4■■■■□ 3.1
Alpk3Q924C5 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Alpk3Q924C5 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC34.39■■■■□ 3.1
Alpk3Q924C5 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
Alpk3Q924C5 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
Alpk3Q924C5 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC34.38■■■■□ 3.09
Alpk3Q924C5 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
Alpk3Q924C5 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
Alpk3Q924C5 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC34.37■■■■□ 3.09
Alpk3Q924C5 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
Alpk3Q924C5 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC34.37■■■■□ 3.09
Alpk3Q924C5 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Alpk3Q924C5 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Alpk3Q924C5 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Alpk3Q924C5 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC34.35■■■■□ 3.09
Alpk3Q924C5 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.34■■■■□ 3.09
Alpk3Q924C5 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Alpk3Q924C5 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC34.33■■■■□ 3.09
Alpk3Q924C5 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
Alpk3Q924C5 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
Alpk3Q924C5 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC34.32■■■■□ 3.08
Alpk3Q924C5 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC34.31■■■■□ 3.08
Alpk3Q924C5 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC34.31■■■■□ 3.08
Alpk3Q924C5 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
Alpk3Q924C5 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
Alpk3Q924C5 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC34.3■■■■□ 3.08
Alpk3Q924C5 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Alpk3Q924C5 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC34.3■■■■□ 3.08
Alpk3Q924C5 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC34.3■■■■□ 3.08
Alpk3Q924C5 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Alpk3Q924C5 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
Alpk3Q924C5 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Alpk3Q924C5 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
Alpk3Q924C5 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC34.29■■■■□ 3.08
Alpk3Q924C5 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Alpk3Q924C5 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC34.28■■■■□ 3.08
Alpk3Q924C5 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
Alpk3Q924C5 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Alpk3Q924C5 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
Alpk3Q924C5 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
Alpk3Q924C5 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC34.26■■■■□ 3.08
Alpk3Q924C5 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Alpk3Q924C5 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Alpk3Q924C5 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
Alpk3Q924C5 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
Alpk3Q924C5 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
Alpk3Q924C5 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
Alpk3Q924C5 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
Alpk3Q924C5 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
Alpk3Q924C5 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Alpk3Q924C5 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Alpk3Q924C5 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
Alpk3Q924C5 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC34.22■■■■□ 3.07
Alpk3Q924C5 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
Alpk3Q924C5 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
Alpk3Q924C5 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC34.2■■■■□ 3.07
Alpk3Q924C5 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Alpk3Q924C5 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC34.19■■■■□ 3.06
Alpk3Q924C5 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Alpk3Q924C5 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Alpk3Q924C5 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Alpk3Q924C5 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Alpk3Q924C5 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC34.15■■■■□ 3.06
Alpk3Q924C5 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
Alpk3Q924C5 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC34.14■■■■□ 3.06
Alpk3Q924C5 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC34.14■■■■□ 3.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 111.7 ms