Protein–RNA interactions for Protein: Q923K4

Gtpbp3, tRNA modification GTPase GTPBP3, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp3Q923K4 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gtpbp3Q923K4 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gtpbp3Q923K4 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gtpbp3Q923K4 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gtpbp3Q923K4 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gtpbp3Q923K4 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gtpbp3Q923K4 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gtpbp3Q923K4 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gtpbp3Q923K4 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gtpbp3Q923K4 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gtpbp3Q923K4 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gtpbp3Q923K4 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Gtpbp3Q923K4 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Gtpbp3Q923K4 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gtpbp3Q923K4 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gtpbp3Q923K4 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gtpbp3Q923K4 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gtpbp3Q923K4 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gtpbp3Q923K4 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gtpbp3Q923K4 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gtpbp3Q923K4 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gtpbp3Q923K4 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gtpbp3Q923K4 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gtpbp3Q923K4 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gtpbp3Q923K4 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gtpbp3Q923K4 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gtpbp3Q923K4 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gtpbp3Q923K4 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gtpbp3Q923K4 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gtpbp3Q923K4 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gtpbp3Q923K4 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gtpbp3Q923K4 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gtpbp3Q923K4 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Gtpbp3Q923K4 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gtpbp3Q923K4 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gtpbp3Q923K4 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gtpbp3Q923K4 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Gtpbp3Q923K4 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gtpbp3Q923K4 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gtpbp3Q923K4 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gtpbp3Q923K4 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gtpbp3Q923K4 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gtpbp3Q923K4 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gtpbp3Q923K4 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gtpbp3Q923K4 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gtpbp3Q923K4 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gtpbp3Q923K4 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gtpbp3Q923K4 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gtpbp3Q923K4 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gtpbp3Q923K4 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gtpbp3Q923K4 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gtpbp3Q923K4 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gtpbp3Q923K4 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gtpbp3Q923K4 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gtpbp3Q923K4 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gtpbp3Q923K4 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gtpbp3Q923K4 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gtpbp3Q923K4 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gtpbp3Q923K4 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gtpbp3Q923K4 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Gtpbp3Q923K4 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gtpbp3Q923K4 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gtpbp3Q923K4 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gtpbp3Q923K4 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gtpbp3Q923K4 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gtpbp3Q923K4 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gtpbp3Q923K4 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gtpbp3Q923K4 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gtpbp3Q923K4 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gtpbp3Q923K4 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Gtpbp3Q923K4 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gtpbp3Q923K4 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gtpbp3Q923K4 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gtpbp3Q923K4 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Gtpbp3Q923K4 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Gtpbp3Q923K4 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gtpbp3Q923K4 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gtpbp3Q923K4 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Gtpbp3Q923K4 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gtpbp3Q923K4 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gtpbp3Q923K4 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gtpbp3Q923K4 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gtpbp3Q923K4 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gtpbp3Q923K4 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gtpbp3Q923K4 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gtpbp3Q923K4 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gtpbp3Q923K4 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gtpbp3Q923K4 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gtpbp3Q923K4 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gtpbp3Q923K4 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gtpbp3Q923K4 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gtpbp3Q923K4 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gtpbp3Q923K4 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gtpbp3Q923K4 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gtpbp3Q923K4 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gtpbp3Q923K4 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Gtpbp3Q923K4 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gtpbp3Q923K4 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gtpbp3Q923K4 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gtpbp3Q923K4 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.7 ms