Protein–RNA interactions for Protein: Q91YR7

Prpf6, Pre-mRNA-processing factor 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 941 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf6Q91YR7 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Prpf6Q91YR7 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Prpf6Q91YR7 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Prpf6Q91YR7 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Prpf6Q91YR7 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Prpf6Q91YR7 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Prpf6Q91YR7 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Prpf6Q91YR7 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Prpf6Q91YR7 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Prpf6Q91YR7 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Prpf6Q91YR7 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Prpf6Q91YR7 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Prpf6Q91YR7 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Prpf6Q91YR7 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Prpf6Q91YR7 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Prpf6Q91YR7 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Prpf6Q91YR7 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Prpf6Q91YR7 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Prpf6Q91YR7 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Prpf6Q91YR7 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Prpf6Q91YR7 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Prpf6Q91YR7 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Prpf6Q91YR7 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Prpf6Q91YR7 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Prpf6Q91YR7 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Prpf6Q91YR7 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Prpf6Q91YR7 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Prpf6Q91YR7 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Prpf6Q91YR7 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Prpf6Q91YR7 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Prpf6Q91YR7 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Prpf6Q91YR7 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Prpf6Q91YR7 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Prpf6Q91YR7 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Prpf6Q91YR7 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Prpf6Q91YR7 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Prpf6Q91YR7 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Prpf6Q91YR7 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Prpf6Q91YR7 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Prpf6Q91YR7 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Prpf6Q91YR7 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Prpf6Q91YR7 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Prpf6Q91YR7 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Prpf6Q91YR7 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Prpf6Q91YR7 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Prpf6Q91YR7 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Prpf6Q91YR7 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Prpf6Q91YR7 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Prpf6Q91YR7 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Prpf6Q91YR7 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Prpf6Q91YR7 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Prpf6Q91YR7 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Prpf6Q91YR7 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Prpf6Q91YR7 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Prpf6Q91YR7 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Prpf6Q91YR7 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Prpf6Q91YR7 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Prpf6Q91YR7 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Prpf6Q91YR7 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Prpf6Q91YR7 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Prpf6Q91YR7 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Prpf6Q91YR7 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Prpf6Q91YR7 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Prpf6Q91YR7 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Prpf6Q91YR7 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Prpf6Q91YR7 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Prpf6Q91YR7 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Prpf6Q91YR7 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Prpf6Q91YR7 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Prpf6Q91YR7 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Prpf6Q91YR7 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Prpf6Q91YR7 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Prpf6Q91YR7 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Prpf6Q91YR7 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Prpf6Q91YR7 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Prpf6Q91YR7 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Prpf6Q91YR7 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Prpf6Q91YR7 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Prpf6Q91YR7 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Prpf6Q91YR7 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Prpf6Q91YR7 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Prpf6Q91YR7 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Prpf6Q91YR7 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Prpf6Q91YR7 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Prpf6Q91YR7 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Prpf6Q91YR7 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Prpf6Q91YR7 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Prpf6Q91YR7 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Prpf6Q91YR7 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Prpf6Q91YR7 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Prpf6Q91YR7 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Prpf6Q91YR7 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Prpf6Q91YR7 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Prpf6Q91YR7 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Prpf6Q91YR7 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Prpf6Q91YR7 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Prpf6Q91YR7 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Prpf6Q91YR7 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Prpf6Q91YR7 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Prpf6Q91YR7 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms