Protein–RNA interactions for Protein: Q91YQ1

Rab29, Ras-related protein Rab-7L1, mousemouse

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Length 204 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab29Q91YQ1 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rab29Q91YQ1 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rab29Q91YQ1 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rab29Q91YQ1 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rab29Q91YQ1 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rab29Q91YQ1 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rab29Q91YQ1 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rab29Q91YQ1 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rab29Q91YQ1 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rab29Q91YQ1 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rab29Q91YQ1 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rab29Q91YQ1 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rab29Q91YQ1 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rab29Q91YQ1 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rab29Q91YQ1 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rab29Q91YQ1 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Rab29Q91YQ1 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rab29Q91YQ1 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rab29Q91YQ1 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rab29Q91YQ1 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rab29Q91YQ1 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rab29Q91YQ1 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rab29Q91YQ1 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rab29Q91YQ1 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rab29Q91YQ1 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rab29Q91YQ1 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rab29Q91YQ1 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rab29Q91YQ1 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rab29Q91YQ1 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rab29Q91YQ1 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rab29Q91YQ1 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rab29Q91YQ1 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rab29Q91YQ1 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Rab29Q91YQ1 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rab29Q91YQ1 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rab29Q91YQ1 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rab29Q91YQ1 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rab29Q91YQ1 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rab29Q91YQ1 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rab29Q91YQ1 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rab29Q91YQ1 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rab29Q91YQ1 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rab29Q91YQ1 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rab29Q91YQ1 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rab29Q91YQ1 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rab29Q91YQ1 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rab29Q91YQ1 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rab29Q91YQ1 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rab29Q91YQ1 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rab29Q91YQ1 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rab29Q91YQ1 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Rab29Q91YQ1 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rab29Q91YQ1 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rab29Q91YQ1 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rab29Q91YQ1 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rab29Q91YQ1 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rab29Q91YQ1 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rab29Q91YQ1 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rab29Q91YQ1 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rab29Q91YQ1 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rab29Q91YQ1 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rab29Q91YQ1 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Rab29Q91YQ1 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Rab29Q91YQ1 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rab29Q91YQ1 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rab29Q91YQ1 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
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Rab29Q91YQ1 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rab29Q91YQ1 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rab29Q91YQ1 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rab29Q91YQ1 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rab29Q91YQ1 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rab29Q91YQ1 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rab29Q91YQ1 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rab29Q91YQ1 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rab29Q91YQ1 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rab29Q91YQ1 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rab29Q91YQ1 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rab29Q91YQ1 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rab29Q91YQ1 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rab29Q91YQ1 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rab29Q91YQ1 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rab29Q91YQ1 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rab29Q91YQ1 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rab29Q91YQ1 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rab29Q91YQ1 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rab29Q91YQ1 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rab29Q91YQ1 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rab29Q91YQ1 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rab29Q91YQ1 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rab29Q91YQ1 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rab29Q91YQ1 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rab29Q91YQ1 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rab29Q91YQ1 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rab29Q91YQ1 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rab29Q91YQ1 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rab29Q91YQ1 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rab29Q91YQ1 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rab29Q91YQ1 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rab29Q91YQ1 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
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