Protein–RNA interactions for Protein: Q91Y00

Pcdhb2, Protocadherin beta 2, mousemouse

Predictions only

Length 799 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdhb2Q91Y00 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pcdhb2Q91Y00 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Pcdhb2Q91Y00 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Pcdhb2Q91Y00 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pcdhb2Q91Y00 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pcdhb2Q91Y00 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pcdhb2Q91Y00 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pcdhb2Q91Y00 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pcdhb2Q91Y00 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Pcdhb2Q91Y00 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Pcdhb2Q91Y00 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pcdhb2Q91Y00 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pcdhb2Q91Y00 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pcdhb2Q91Y00 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pcdhb2Q91Y00 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pcdhb2Q91Y00 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pcdhb2Q91Y00 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pcdhb2Q91Y00 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pcdhb2Q91Y00 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pcdhb2Q91Y00 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pcdhb2Q91Y00 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pcdhb2Q91Y00 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pcdhb2Q91Y00 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pcdhb2Q91Y00 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pcdhb2Q91Y00 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pcdhb2Q91Y00 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pcdhb2Q91Y00 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pcdhb2Q91Y00 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pcdhb2Q91Y00 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pcdhb2Q91Y00 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pcdhb2Q91Y00 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pcdhb2Q91Y00 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pcdhb2Q91Y00 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pcdhb2Q91Y00 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pcdhb2Q91Y00 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pcdhb2Q91Y00 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pcdhb2Q91Y00 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pcdhb2Q91Y00 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pcdhb2Q91Y00 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pcdhb2Q91Y00 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pcdhb2Q91Y00 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pcdhb2Q91Y00 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pcdhb2Q91Y00 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pcdhb2Q91Y00 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pcdhb2Q91Y00 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pcdhb2Q91Y00 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pcdhb2Q91Y00 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pcdhb2Q91Y00 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pcdhb2Q91Y00 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pcdhb2Q91Y00 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pcdhb2Q91Y00 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pcdhb2Q91Y00 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pcdhb2Q91Y00 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pcdhb2Q91Y00 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pcdhb2Q91Y00 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pcdhb2Q91Y00 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pcdhb2Q91Y00 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pcdhb2Q91Y00 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pcdhb2Q91Y00 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pcdhb2Q91Y00 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pcdhb2Q91Y00 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pcdhb2Q91Y00 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pcdhb2Q91Y00 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pcdhb2Q91Y00 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pcdhb2Q91Y00 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pcdhb2Q91Y00 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pcdhb2Q91Y00 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pcdhb2Q91Y00 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pcdhb2Q91Y00 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pcdhb2Q91Y00 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Pcdhb2Q91Y00 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pcdhb2Q91Y00 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pcdhb2Q91Y00 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pcdhb2Q91Y00 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pcdhb2Q91Y00 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pcdhb2Q91Y00 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pcdhb2Q91Y00 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pcdhb2Q91Y00 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pcdhb2Q91Y00 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pcdhb2Q91Y00 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pcdhb2Q91Y00 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pcdhb2Q91Y00 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pcdhb2Q91Y00 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pcdhb2Q91Y00 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pcdhb2Q91Y00 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pcdhb2Q91Y00 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pcdhb2Q91Y00 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pcdhb2Q91Y00 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pcdhb2Q91Y00 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pcdhb2Q91Y00 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pcdhb2Q91Y00 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pcdhb2Q91Y00 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pcdhb2Q91Y00 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pcdhb2Q91Y00 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pcdhb2Q91Y00 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pcdhb2Q91Y00 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pcdhb2Q91Y00 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pcdhb2Q91Y00 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pcdhb2Q91Y00 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pcdhb2Q91Y00 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms