Protein–RNA interactions for Protein: Q91XY7

Pcdhga12, Protocadherin gamma A12, mousemouse

Predictions only

Length 932 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdhga12Q91XY7 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Pcdhga12Q91XY7 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pcdhga12Q91XY7 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pcdhga12Q91XY7 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pcdhga12Q91XY7 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pcdhga12Q91XY7 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pcdhga12Q91XY7 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pcdhga12Q91XY7 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pcdhga12Q91XY7 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pcdhga12Q91XY7 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pcdhga12Q91XY7 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pcdhga12Q91XY7 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pcdhga12Q91XY7 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Pcdhga12Q91XY7 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pcdhga12Q91XY7 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pcdhga12Q91XY7 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pcdhga12Q91XY7 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pcdhga12Q91XY7 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pcdhga12Q91XY7 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pcdhga12Q91XY7 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pcdhga12Q91XY7 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pcdhga12Q91XY7 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pcdhga12Q91XY7 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pcdhga12Q91XY7 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pcdhga12Q91XY7 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pcdhga12Q91XY7 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pcdhga12Q91XY7 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pcdhga12Q91XY7 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pcdhga12Q91XY7 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pcdhga12Q91XY7 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pcdhga12Q91XY7 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pcdhga12Q91XY7 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pcdhga12Q91XY7 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pcdhga12Q91XY7 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pcdhga12Q91XY7 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pcdhga12Q91XY7 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pcdhga12Q91XY7 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pcdhga12Q91XY7 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pcdhga12Q91XY7 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pcdhga12Q91XY7 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pcdhga12Q91XY7 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pcdhga12Q91XY7 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pcdhga12Q91XY7 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pcdhga12Q91XY7 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pcdhga12Q91XY7 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pcdhga12Q91XY7 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pcdhga12Q91XY7 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pcdhga12Q91XY7 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pcdhga12Q91XY7 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pcdhga12Q91XY7 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pcdhga12Q91XY7 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Pcdhga12Q91XY7 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pcdhga12Q91XY7 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pcdhga12Q91XY7 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pcdhga12Q91XY7 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pcdhga12Q91XY7 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pcdhga12Q91XY7 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pcdhga12Q91XY7 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pcdhga12Q91XY7 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pcdhga12Q91XY7 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pcdhga12Q91XY7 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pcdhga12Q91XY7 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pcdhga12Q91XY7 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pcdhga12Q91XY7 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pcdhga12Q91XY7 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pcdhga12Q91XY7 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pcdhga12Q91XY7 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pcdhga12Q91XY7 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pcdhga12Q91XY7 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pcdhga12Q91XY7 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pcdhga12Q91XY7 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pcdhga12Q91XY7 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Pcdhga12Q91XY7 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pcdhga12Q91XY7 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pcdhga12Q91XY7 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pcdhga12Q91XY7 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pcdhga12Q91XY7 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pcdhga12Q91XY7 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pcdhga12Q91XY7 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pcdhga12Q91XY7 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pcdhga12Q91XY7 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pcdhga12Q91XY7 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pcdhga12Q91XY7 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pcdhga12Q91XY7 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pcdhga12Q91XY7 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pcdhga12Q91XY7 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pcdhga12Q91XY7 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pcdhga12Q91XY7 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pcdhga12Q91XY7 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pcdhga12Q91XY7 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pcdhga12Q91XY7 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Pcdhga12Q91XY7 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Pcdhga12Q91XY7 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pcdhga12Q91XY7 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pcdhga12Q91XY7 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Pcdhga12Q91XY7 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Pcdhga12Q91XY7 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pcdhga12Q91XY7 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pcdhga12Q91XY7 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pcdhga12Q91XY7 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms