Protein–RNA interactions for Protein: Q91XD2

Lims2, LIM and senescent cell antigen-like-containing domain protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lims2Q91XD2 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Lims2Q91XD2 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lims2Q91XD2 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lims2Q91XD2 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lims2Q91XD2 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lims2Q91XD2 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lims2Q91XD2 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lims2Q91XD2 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lims2Q91XD2 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lims2Q91XD2 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Lims2Q91XD2 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lims2Q91XD2 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lims2Q91XD2 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Lims2Q91XD2 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Lims2Q91XD2 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Lims2Q91XD2 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Lims2Q91XD2 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Lims2Q91XD2 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Lims2Q91XD2 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Lims2Q91XD2 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Lims2Q91XD2 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Lims2Q91XD2 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Lims2Q91XD2 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Lims2Q91XD2 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Lims2Q91XD2 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Lims2Q91XD2 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Lims2Q91XD2 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Lims2Q91XD2 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Lims2Q91XD2 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Lims2Q91XD2 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Lims2Q91XD2 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Lims2Q91XD2 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Lims2Q91XD2 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Lims2Q91XD2 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lims2Q91XD2 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lims2Q91XD2 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lims2Q91XD2 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lims2Q91XD2 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lims2Q91XD2 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Lims2Q91XD2 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lims2Q91XD2 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lims2Q91XD2 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Lims2Q91XD2 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Lims2Q91XD2 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Lims2Q91XD2 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Lims2Q91XD2 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lims2Q91XD2 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lims2Q91XD2 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lims2Q91XD2 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lims2Q91XD2 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lims2Q91XD2 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lims2Q91XD2 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lims2Q91XD2 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lims2Q91XD2 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lims2Q91XD2 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lims2Q91XD2 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lims2Q91XD2 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lims2Q91XD2 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lims2Q91XD2 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lims2Q91XD2 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lims2Q91XD2 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Lims2Q91XD2 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lims2Q91XD2 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lims2Q91XD2 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lims2Q91XD2 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lims2Q91XD2 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lims2Q91XD2 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lims2Q91XD2 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lims2Q91XD2 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lims2Q91XD2 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lims2Q91XD2 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lims2Q91XD2 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lims2Q91XD2 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Lims2Q91XD2 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Lims2Q91XD2 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lims2Q91XD2 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lims2Q91XD2 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lims2Q91XD2 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lims2Q91XD2 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lims2Q91XD2 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lims2Q91XD2 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lims2Q91XD2 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Lims2Q91XD2 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Lims2Q91XD2 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lims2Q91XD2 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Lims2Q91XD2 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Lims2Q91XD2 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Lims2Q91XD2 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lims2Q91XD2 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lims2Q91XD2 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lims2Q91XD2 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lims2Q91XD2 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lims2Q91XD2 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lims2Q91XD2 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lims2Q91XD2 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lims2Q91XD2 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Lims2Q91XD2 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lims2Q91XD2 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lims2Q91XD2 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lims2Q91XD2 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms