Protein–RNA interactions for Protein: Q91WC0

Setd3, Histone-lysine N-methyltransferase setd3, mousemouse

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setd3Q91WC0 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Setd3Q91WC0 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Setd3Q91WC0 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Setd3Q91WC0 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Setd3Q91WC0 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Setd3Q91WC0 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Setd3Q91WC0 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Setd3Q91WC0 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Setd3Q91WC0 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Setd3Q91WC0 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Setd3Q91WC0 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Setd3Q91WC0 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Setd3Q91WC0 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Setd3Q91WC0 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Setd3Q91WC0 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Setd3Q91WC0 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Setd3Q91WC0 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Setd3Q91WC0 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Setd3Q91WC0 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Setd3Q91WC0 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Setd3Q91WC0 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Setd3Q91WC0 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Setd3Q91WC0 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Setd3Q91WC0 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Setd3Q91WC0 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Setd3Q91WC0 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Setd3Q91WC0 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Setd3Q91WC0 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Setd3Q91WC0 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Setd3Q91WC0 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Setd3Q91WC0 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Setd3Q91WC0 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Setd3Q91WC0 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Setd3Q91WC0 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Setd3Q91WC0 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Setd3Q91WC0 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Setd3Q91WC0 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Setd3Q91WC0 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Setd3Q91WC0 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Setd3Q91WC0 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Setd3Q91WC0 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Setd3Q91WC0 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Setd3Q91WC0 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Setd3Q91WC0 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Setd3Q91WC0 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Setd3Q91WC0 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Setd3Q91WC0 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Setd3Q91WC0 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Setd3Q91WC0 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Setd3Q91WC0 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Setd3Q91WC0 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Setd3Q91WC0 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Setd3Q91WC0 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Setd3Q91WC0 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Setd3Q91WC0 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Setd3Q91WC0 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Setd3Q91WC0 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Setd3Q91WC0 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Setd3Q91WC0 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Setd3Q91WC0 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Setd3Q91WC0 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Setd3Q91WC0 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Setd3Q91WC0 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Setd3Q91WC0 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Setd3Q91WC0 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Setd3Q91WC0 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Setd3Q91WC0 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Setd3Q91WC0 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Setd3Q91WC0 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Setd3Q91WC0 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Setd3Q91WC0 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Setd3Q91WC0 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Setd3Q91WC0 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Setd3Q91WC0 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Setd3Q91WC0 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Setd3Q91WC0 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Setd3Q91WC0 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Setd3Q91WC0 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Setd3Q91WC0 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Setd3Q91WC0 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Setd3Q91WC0 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Setd3Q91WC0 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Setd3Q91WC0 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Setd3Q91WC0 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Setd3Q91WC0 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Setd3Q91WC0 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Setd3Q91WC0 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Setd3Q91WC0 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Setd3Q91WC0 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Setd3Q91WC0 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Setd3Q91WC0 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Setd3Q91WC0 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Setd3Q91WC0 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Setd3Q91WC0 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Setd3Q91WC0 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Setd3Q91WC0 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Setd3Q91WC0 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Setd3Q91WC0 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Setd3Q91WC0 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Setd3Q91WC0 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms