Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEE1

Lmcd1, LIM and cysteine-rich domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmcd1Q8VEE1 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Lmcd1Q8VEE1 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Lmcd1Q8VEE1 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Lmcd1Q8VEE1 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Lmcd1Q8VEE1 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Lmcd1Q8VEE1 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Lmcd1Q8VEE1 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Lmcd1Q8VEE1 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Lmcd1Q8VEE1 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Lmcd1Q8VEE1 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Lmcd1Q8VEE1 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Lmcd1Q8VEE1 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Lmcd1Q8VEE1 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Lmcd1Q8VEE1 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Lmcd1Q8VEE1 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Lmcd1Q8VEE1 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Lmcd1Q8VEE1 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Lmcd1Q8VEE1 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Lmcd1Q8VEE1 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Lmcd1Q8VEE1 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Lmcd1Q8VEE1 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Lmcd1Q8VEE1 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Lmcd1Q8VEE1 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Lmcd1Q8VEE1 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Lmcd1Q8VEE1 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Lmcd1Q8VEE1 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Lmcd1Q8VEE1 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Lmcd1Q8VEE1 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Lmcd1Q8VEE1 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Lmcd1Q8VEE1 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Lmcd1Q8VEE1 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Lmcd1Q8VEE1 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Lmcd1Q8VEE1 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Lmcd1Q8VEE1 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Lmcd1Q8VEE1 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Lmcd1Q8VEE1 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Lmcd1Q8VEE1 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Lmcd1Q8VEE1 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Lmcd1Q8VEE1 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Lmcd1Q8VEE1 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Lmcd1Q8VEE1 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Lmcd1Q8VEE1 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Lmcd1Q8VEE1 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Lmcd1Q8VEE1 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Lmcd1Q8VEE1 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Lmcd1Q8VEE1 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Lmcd1Q8VEE1 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Lmcd1Q8VEE1 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Lmcd1Q8VEE1 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Lmcd1Q8VEE1 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Lmcd1Q8VEE1 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Lmcd1Q8VEE1 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Lmcd1Q8VEE1 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Lmcd1Q8VEE1 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Lmcd1Q8VEE1 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Lmcd1Q8VEE1 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Lmcd1Q8VEE1 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Lmcd1Q8VEE1 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Lmcd1Q8VEE1 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Lmcd1Q8VEE1 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Lmcd1Q8VEE1 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Lmcd1Q8VEE1 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Lmcd1Q8VEE1 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Lmcd1Q8VEE1 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Lmcd1Q8VEE1 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Lmcd1Q8VEE1 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Lmcd1Q8VEE1 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Lmcd1Q8VEE1 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Lmcd1Q8VEE1 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Lmcd1Q8VEE1 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Lmcd1Q8VEE1 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Lmcd1Q8VEE1 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Lmcd1Q8VEE1 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Lmcd1Q8VEE1 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Lmcd1Q8VEE1 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Lmcd1Q8VEE1 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Lmcd1Q8VEE1 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Lmcd1Q8VEE1 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Lmcd1Q8VEE1 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Lmcd1Q8VEE1 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Lmcd1Q8VEE1 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Lmcd1Q8VEE1 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Lmcd1Q8VEE1 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Lmcd1Q8VEE1 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Lmcd1Q8VEE1 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Lmcd1Q8VEE1 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Lmcd1Q8VEE1 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Lmcd1Q8VEE1 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Lmcd1Q8VEE1 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Lmcd1Q8VEE1 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Lmcd1Q8VEE1 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Lmcd1Q8VEE1 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Lmcd1Q8VEE1 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Lmcd1Q8VEE1 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Lmcd1Q8VEE1 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Lmcd1Q8VEE1 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Lmcd1Q8VEE1 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Lmcd1Q8VEE1 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Lmcd1Q8VEE1 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Lmcd1Q8VEE1 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms