Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDS4

Rprd1a, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1A, mousemouse

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1aQ8VDS4 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rprd1aQ8VDS4 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rprd1aQ8VDS4 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rprd1aQ8VDS4 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rprd1aQ8VDS4 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rprd1aQ8VDS4 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rprd1aQ8VDS4 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rprd1aQ8VDS4 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rprd1aQ8VDS4 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Rprd1aQ8VDS4 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rprd1aQ8VDS4 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Rprd1aQ8VDS4 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rprd1aQ8VDS4 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rprd1aQ8VDS4 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Rprd1aQ8VDS4 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Rprd1aQ8VDS4 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rprd1aQ8VDS4 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rprd1aQ8VDS4 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Rprd1aQ8VDS4 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rprd1aQ8VDS4 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rprd1aQ8VDS4 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rprd1aQ8VDS4 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rprd1aQ8VDS4 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rprd1aQ8VDS4 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rprd1aQ8VDS4 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rprd1aQ8VDS4 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rprd1aQ8VDS4 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rprd1aQ8VDS4 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rprd1aQ8VDS4 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rprd1aQ8VDS4 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rprd1aQ8VDS4 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rprd1aQ8VDS4 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rprd1aQ8VDS4 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rprd1aQ8VDS4 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rprd1aQ8VDS4 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rprd1aQ8VDS4 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rprd1aQ8VDS4 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rprd1aQ8VDS4 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rprd1aQ8VDS4 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rprd1aQ8VDS4 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rprd1aQ8VDS4 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rprd1aQ8VDS4 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rprd1aQ8VDS4 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rprd1aQ8VDS4 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rprd1aQ8VDS4 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rprd1aQ8VDS4 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rprd1aQ8VDS4 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rprd1aQ8VDS4 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rprd1aQ8VDS4 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rprd1aQ8VDS4 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rprd1aQ8VDS4 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rprd1aQ8VDS4 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rprd1aQ8VDS4 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rprd1aQ8VDS4 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rprd1aQ8VDS4 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rprd1aQ8VDS4 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rprd1aQ8VDS4 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rprd1aQ8VDS4 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rprd1aQ8VDS4 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rprd1aQ8VDS4 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rprd1aQ8VDS4 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rprd1aQ8VDS4 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rprd1aQ8VDS4 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rprd1aQ8VDS4 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rprd1aQ8VDS4 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rprd1aQ8VDS4 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rprd1aQ8VDS4 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rprd1aQ8VDS4 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rprd1aQ8VDS4 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rprd1aQ8VDS4 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rprd1aQ8VDS4 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rprd1aQ8VDS4 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rprd1aQ8VDS4 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rprd1aQ8VDS4 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rprd1aQ8VDS4 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rprd1aQ8VDS4 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rprd1aQ8VDS4 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rprd1aQ8VDS4 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rprd1aQ8VDS4 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rprd1aQ8VDS4 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rprd1aQ8VDS4 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rprd1aQ8VDS4 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rprd1aQ8VDS4 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rprd1aQ8VDS4 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rprd1aQ8VDS4 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rprd1aQ8VDS4 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rprd1aQ8VDS4 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rprd1aQ8VDS4 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rprd1aQ8VDS4 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rprd1aQ8VDS4 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rprd1aQ8VDS4 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rprd1aQ8VDS4 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rprd1aQ8VDS4 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rprd1aQ8VDS4 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Rprd1aQ8VDS4 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rprd1aQ8VDS4 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rprd1aQ8VDS4 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rprd1aQ8VDS4 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rprd1aQ8VDS4 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rprd1aQ8VDS4 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms