Protein–RNA interactions for Protein: Q8VD76

Gtf2h3, General transcription factor IIH subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2h3Q8VD76 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gtf2h3Q8VD76 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Gtf2h3Q8VD76 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Gtf2h3Q8VD76 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gtf2h3Q8VD76 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gtf2h3Q8VD76 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gtf2h3Q8VD76 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gtf2h3Q8VD76 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gtf2h3Q8VD76 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gtf2h3Q8VD76 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gtf2h3Q8VD76 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Gtf2h3Q8VD76 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gtf2h3Q8VD76 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gtf2h3Q8VD76 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gtf2h3Q8VD76 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gtf2h3Q8VD76 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gtf2h3Q8VD76 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gtf2h3Q8VD76 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gtf2h3Q8VD76 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gtf2h3Q8VD76 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gtf2h3Q8VD76 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gtf2h3Q8VD76 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gtf2h3Q8VD76 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gtf2h3Q8VD76 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gtf2h3Q8VD76 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gtf2h3Q8VD76 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gtf2h3Q8VD76 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Gtf2h3Q8VD76 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gtf2h3Q8VD76 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gtf2h3Q8VD76 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gtf2h3Q8VD76 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gtf2h3Q8VD76 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gtf2h3Q8VD76 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gtf2h3Q8VD76 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Gtf2h3Q8VD76 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gtf2h3Q8VD76 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gtf2h3Q8VD76 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gtf2h3Q8VD76 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gtf2h3Q8VD76 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gtf2h3Q8VD76 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gtf2h3Q8VD76 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gtf2h3Q8VD76 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gtf2h3Q8VD76 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gtf2h3Q8VD76 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gtf2h3Q8VD76 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gtf2h3Q8VD76 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gtf2h3Q8VD76 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gtf2h3Q8VD76 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gtf2h3Q8VD76 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gtf2h3Q8VD76 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gtf2h3Q8VD76 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gtf2h3Q8VD76 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gtf2h3Q8VD76 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gtf2h3Q8VD76 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gtf2h3Q8VD76 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gtf2h3Q8VD76 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gtf2h3Q8VD76 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gtf2h3Q8VD76 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gtf2h3Q8VD76 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gtf2h3Q8VD76 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gtf2h3Q8VD76 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gtf2h3Q8VD76 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gtf2h3Q8VD76 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gtf2h3Q8VD76 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gtf2h3Q8VD76 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gtf2h3Q8VD76 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gtf2h3Q8VD76 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gtf2h3Q8VD76 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gtf2h3Q8VD76 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gtf2h3Q8VD76 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gtf2h3Q8VD76 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gtf2h3Q8VD76 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gtf2h3Q8VD76 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gtf2h3Q8VD76 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gtf2h3Q8VD76 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gtf2h3Q8VD76 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gtf2h3Q8VD76 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gtf2h3Q8VD76 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gtf2h3Q8VD76 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gtf2h3Q8VD76 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gtf2h3Q8VD76 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gtf2h3Q8VD76 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gtf2h3Q8VD76 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gtf2h3Q8VD76 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gtf2h3Q8VD76 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gtf2h3Q8VD76 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gtf2h3Q8VD76 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gtf2h3Q8VD76 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gtf2h3Q8VD76 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gtf2h3Q8VD76 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gtf2h3Q8VD76 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gtf2h3Q8VD76 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gtf2h3Q8VD76 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gtf2h3Q8VD76 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gtf2h3Q8VD76 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gtf2h3Q8VD76 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gtf2h3Q8VD76 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gtf2h3Q8VD76 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gtf2h3Q8VD76 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gtf2h3Q8VD76 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 113.6 ms