Protein–RNA interactions for Protein: Q8VC34

Rpap2, Putative RNA polymerase II subunit B1 CTD phosphatase Rpap2, mousemouse

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpap2Q8VC34 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rpap2Q8VC34 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rpap2Q8VC34 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rpap2Q8VC34 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rpap2Q8VC34 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rpap2Q8VC34 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rpap2Q8VC34 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rpap2Q8VC34 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rpap2Q8VC34 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rpap2Q8VC34 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rpap2Q8VC34 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rpap2Q8VC34 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rpap2Q8VC34 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Rpap2Q8VC34 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rpap2Q8VC34 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rpap2Q8VC34 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rpap2Q8VC34 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rpap2Q8VC34 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rpap2Q8VC34 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rpap2Q8VC34 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Rpap2Q8VC34 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Rpap2Q8VC34 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Rpap2Q8VC34 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Rpap2Q8VC34 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Rpap2Q8VC34 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Rpap2Q8VC34 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Rpap2Q8VC34 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rpap2Q8VC34 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rpap2Q8VC34 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Rpap2Q8VC34 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rpap2Q8VC34 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rpap2Q8VC34 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rpap2Q8VC34 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rpap2Q8VC34 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rpap2Q8VC34 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rpap2Q8VC34 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rpap2Q8VC34 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rpap2Q8VC34 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rpap2Q8VC34 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rpap2Q8VC34 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Rpap2Q8VC34 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Rpap2Q8VC34 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Rpap2Q8VC34 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Rpap2Q8VC34 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rpap2Q8VC34 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rpap2Q8VC34 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rpap2Q8VC34 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rpap2Q8VC34 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rpap2Q8VC34 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rpap2Q8VC34 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Rpap2Q8VC34 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rpap2Q8VC34 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rpap2Q8VC34 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rpap2Q8VC34 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rpap2Q8VC34 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rpap2Q8VC34 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rpap2Q8VC34 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Rpap2Q8VC34 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rpap2Q8VC34 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rpap2Q8VC34 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rpap2Q8VC34 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rpap2Q8VC34 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rpap2Q8VC34 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rpap2Q8VC34 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Rpap2Q8VC34 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rpap2Q8VC34 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rpap2Q8VC34 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Rpap2Q8VC34 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Rpap2Q8VC34 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Rpap2Q8VC34 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rpap2Q8VC34 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rpap2Q8VC34 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rpap2Q8VC34 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rpap2Q8VC34 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rpap2Q8VC34 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rpap2Q8VC34 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rpap2Q8VC34 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rpap2Q8VC34 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rpap2Q8VC34 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rpap2Q8VC34 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rpap2Q8VC34 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rpap2Q8VC34 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rpap2Q8VC34 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rpap2Q8VC34 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rpap2Q8VC34 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rpap2Q8VC34 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rpap2Q8VC34 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rpap2Q8VC34 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rpap2Q8VC34 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rpap2Q8VC34 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rpap2Q8VC34 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rpap2Q8VC34 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rpap2Q8VC34 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rpap2Q8VC34 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rpap2Q8VC34 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rpap2Q8VC34 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Rpap2Q8VC34 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rpap2Q8VC34 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rpap2Q8VC34 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rpap2Q8VC34 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.5 ms