Protein–RNA interactions for Protein: Q8R123

Flad1, FAD synthase, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Flad1Q8R123 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Flad1Q8R123 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Flad1Q8R123 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Flad1Q8R123 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Flad1Q8R123 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
Flad1Q8R123 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Flad1Q8R123 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Flad1Q8R123 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Flad1Q8R123 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
Flad1Q8R123 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Flad1Q8R123 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
Flad1Q8R123 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
Flad1Q8R123 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Flad1Q8R123 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Flad1Q8R123 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Flad1Q8R123 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Flad1Q8R123 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Flad1Q8R123 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Flad1Q8R123 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Flad1Q8R123 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Flad1Q8R123 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Flad1Q8R123 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Flad1Q8R123 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Flad1Q8R123 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Flad1Q8R123 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Flad1Q8R123 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Flad1Q8R123 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Flad1Q8R123 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Flad1Q8R123 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Flad1Q8R123 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Flad1Q8R123 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Flad1Q8R123 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Flad1Q8R123 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Flad1Q8R123 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Flad1Q8R123 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Flad1Q8R123 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Flad1Q8R123 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Flad1Q8R123 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Flad1Q8R123 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Flad1Q8R123 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
Flad1Q8R123 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Flad1Q8R123 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Flad1Q8R123 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Flad1Q8R123 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Flad1Q8R123 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Flad1Q8R123 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Flad1Q8R123 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Flad1Q8R123 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Flad1Q8R123 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Flad1Q8R123 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
Flad1Q8R123 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Flad1Q8R123 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Flad1Q8R123 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Flad1Q8R123 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Flad1Q8R123 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Flad1Q8R123 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
Flad1Q8R123 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Flad1Q8R123 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Flad1Q8R123 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Flad1Q8R123 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Flad1Q8R123 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Flad1Q8R123 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Flad1Q8R123 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Flad1Q8R123 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Flad1Q8R123 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Flad1Q8R123 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Flad1Q8R123 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Flad1Q8R123 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Flad1Q8R123 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Flad1Q8R123 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Flad1Q8R123 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Flad1Q8R123 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
Flad1Q8R123 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Flad1Q8R123 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Flad1Q8R123 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Flad1Q8R123 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Flad1Q8R123 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Flad1Q8R123 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
Flad1Q8R123 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Flad1Q8R123 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Flad1Q8R123 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Flad1Q8R123 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Flad1Q8R123 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Flad1Q8R123 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Flad1Q8R123 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Flad1Q8R123 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Flad1Q8R123 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Flad1Q8R123 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Flad1Q8R123 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Flad1Q8R123 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Flad1Q8R123 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Flad1Q8R123 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Flad1Q8R123 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Flad1Q8R123 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Flad1Q8R123 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Flad1Q8R123 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
Flad1Q8R123 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
Flad1Q8R123 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
Flad1Q8R123 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
Flad1Q8R123 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.9 ms