Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4L4

Pof1b, Protein POF1B, mousemouse

Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pof1bQ8K4L4 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Pof1bQ8K4L4 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Pof1bQ8K4L4 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Pof1bQ8K4L4 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Pof1bQ8K4L4 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Pof1bQ8K4L4 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Pof1bQ8K4L4 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Pof1bQ8K4L4 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Pof1bQ8K4L4 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Pof1bQ8K4L4 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Pof1bQ8K4L4 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Pof1bQ8K4L4 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Pof1bQ8K4L4 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Pof1bQ8K4L4 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Pof1bQ8K4L4 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Pof1bQ8K4L4 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Pof1bQ8K4L4 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Pof1bQ8K4L4 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Pof1bQ8K4L4 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Pof1bQ8K4L4 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Pof1bQ8K4L4 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Pof1bQ8K4L4 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Pof1bQ8K4L4 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Pof1bQ8K4L4 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Pof1bQ8K4L4 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Pof1bQ8K4L4 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Pof1bQ8K4L4 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Pof1bQ8K4L4 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Pof1bQ8K4L4 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Pof1bQ8K4L4 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Pof1bQ8K4L4 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Pof1bQ8K4L4 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Pof1bQ8K4L4 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Pof1bQ8K4L4 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Pof1bQ8K4L4 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Pof1bQ8K4L4 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Pof1bQ8K4L4 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Pof1bQ8K4L4 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Pof1bQ8K4L4 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Pof1bQ8K4L4 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Pof1bQ8K4L4 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Pof1bQ8K4L4 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Pof1bQ8K4L4 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Pof1bQ8K4L4 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Pof1bQ8K4L4 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Pof1bQ8K4L4 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Pof1bQ8K4L4 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Pof1bQ8K4L4 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Pof1bQ8K4L4 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Pof1bQ8K4L4 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Pof1bQ8K4L4 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Pof1bQ8K4L4 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Pof1bQ8K4L4 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Pof1bQ8K4L4 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Pof1bQ8K4L4 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Pof1bQ8K4L4 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Pof1bQ8K4L4 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Pof1bQ8K4L4 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Pof1bQ8K4L4 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Pof1bQ8K4L4 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Pof1bQ8K4L4 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Pof1bQ8K4L4 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Pof1bQ8K4L4 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Pof1bQ8K4L4 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Pof1bQ8K4L4 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Pof1bQ8K4L4 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Pof1bQ8K4L4 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Pof1bQ8K4L4 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Pof1bQ8K4L4 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Pof1bQ8K4L4 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Pof1bQ8K4L4 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Pof1bQ8K4L4 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Pof1bQ8K4L4 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Pof1bQ8K4L4 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Pof1bQ8K4L4 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Pof1bQ8K4L4 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Pof1bQ8K4L4 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Pof1bQ8K4L4 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
Pof1bQ8K4L4 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
Pof1bQ8K4L4 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Pof1bQ8K4L4 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
Pof1bQ8K4L4 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
Pof1bQ8K4L4 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
Pof1bQ8K4L4 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Pof1bQ8K4L4 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Pof1bQ8K4L4 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Pof1bQ8K4L4 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Pof1bQ8K4L4 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Pof1bQ8K4L4 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Pof1bQ8K4L4 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Pof1bQ8K4L4 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Pof1bQ8K4L4 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Pof1bQ8K4L4 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Pof1bQ8K4L4 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Pof1bQ8K4L4 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Pof1bQ8K4L4 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Pof1bQ8K4L4 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Pof1bQ8K4L4 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Pof1bQ8K4L4 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Pof1bQ8K4L4 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.4 ms