Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3M1

Rdh16f2, Cis-retinol/3alpha hydroxysterol short-chain dehydrogenase-like protein, mousemouse

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Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh16f2Q8K3M1 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rdh16f2Q8K3M1 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rdh16f2Q8K3M1 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rdh16f2Q8K3M1 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rdh16f2Q8K3M1 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rdh16f2Q8K3M1 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rdh16f2Q8K3M1 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rdh16f2Q8K3M1 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rdh16f2Q8K3M1 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Rdh16f2Q8K3M1 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rdh16f2Q8K3M1 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rdh16f2Q8K3M1 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rdh16f2Q8K3M1 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rdh16f2Q8K3M1 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rdh16f2Q8K3M1 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rdh16f2Q8K3M1 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rdh16f2Q8K3M1 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rdh16f2Q8K3M1 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rdh16f2Q8K3M1 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rdh16f2Q8K3M1 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rdh16f2Q8K3M1 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rdh16f2Q8K3M1 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rdh16f2Q8K3M1 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rdh16f2Q8K3M1 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rdh16f2Q8K3M1 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rdh16f2Q8K3M1 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rdh16f2Q8K3M1 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rdh16f2Q8K3M1 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rdh16f2Q8K3M1 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rdh16f2Q8K3M1 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rdh16f2Q8K3M1 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rdh16f2Q8K3M1 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rdh16f2Q8K3M1 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rdh16f2Q8K3M1 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rdh16f2Q8K3M1 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rdh16f2Q8K3M1 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rdh16f2Q8K3M1 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rdh16f2Q8K3M1 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rdh16f2Q8K3M1 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rdh16f2Q8K3M1 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rdh16f2Q8K3M1 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rdh16f2Q8K3M1 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rdh16f2Q8K3M1 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rdh16f2Q8K3M1 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rdh16f2Q8K3M1 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rdh16f2Q8K3M1 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Rdh16f2Q8K3M1 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rdh16f2Q8K3M1 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rdh16f2Q8K3M1 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rdh16f2Q8K3M1 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Rdh16f2Q8K3M1 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rdh16f2Q8K3M1 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rdh16f2Q8K3M1 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rdh16f2Q8K3M1 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rdh16f2Q8K3M1 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rdh16f2Q8K3M1 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rdh16f2Q8K3M1 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Rdh16f2Q8K3M1 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rdh16f2Q8K3M1 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rdh16f2Q8K3M1 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rdh16f2Q8K3M1 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rdh16f2Q8K3M1 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rdh16f2Q8K3M1 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rdh16f2Q8K3M1 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rdh16f2Q8K3M1 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rdh16f2Q8K3M1 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rdh16f2Q8K3M1 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Rdh16f2Q8K3M1 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rdh16f2Q8K3M1 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rdh16f2Q8K3M1 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rdh16f2Q8K3M1 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rdh16f2Q8K3M1 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rdh16f2Q8K3M1 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rdh16f2Q8K3M1 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rdh16f2Q8K3M1 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Rdh16f2Q8K3M1 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Rdh16f2Q8K3M1 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Rdh16f2Q8K3M1 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Rdh16f2Q8K3M1 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rdh16f2Q8K3M1 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rdh16f2Q8K3M1 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rdh16f2Q8K3M1 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rdh16f2Q8K3M1 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Rdh16f2Q8K3M1 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Rdh16f2Q8K3M1 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Rdh16f2Q8K3M1 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rdh16f2Q8K3M1 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rdh16f2Q8K3M1 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rdh16f2Q8K3M1 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rdh16f2Q8K3M1 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rdh16f2Q8K3M1 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Rdh16f2Q8K3M1 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rdh16f2Q8K3M1 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rdh16f2Q8K3M1 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rdh16f2Q8K3M1 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rdh16f2Q8K3M1 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rdh16f2Q8K3M1 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Rdh16f2Q8K3M1 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Rdh16f2Q8K3M1 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rdh16f2Q8K3M1 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86 ms