Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1J5

Sde2, Replication stress response regulator SDE2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sde2Q8K1J5 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Sde2Q8K1J5 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Sde2Q8K1J5 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Sde2Q8K1J5 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Sde2Q8K1J5 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Sde2Q8K1J5 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Sde2Q8K1J5 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Sde2Q8K1J5 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Sde2Q8K1J5 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Sde2Q8K1J5 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Sde2Q8K1J5 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Sde2Q8K1J5 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Sde2Q8K1J5 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Sde2Q8K1J5 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Sde2Q8K1J5 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Sde2Q8K1J5 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Sde2Q8K1J5 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Sde2Q8K1J5 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Sde2Q8K1J5 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Sde2Q8K1J5 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Sde2Q8K1J5 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Sde2Q8K1J5 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Sde2Q8K1J5 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Sde2Q8K1J5 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Sde2Q8K1J5 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Sde2Q8K1J5 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Sde2Q8K1J5 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Sde2Q8K1J5 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Sde2Q8K1J5 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Sde2Q8K1J5 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Sde2Q8K1J5 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Sde2Q8K1J5 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Sde2Q8K1J5 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Sde2Q8K1J5 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Sde2Q8K1J5 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Sde2Q8K1J5 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Sde2Q8K1J5 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Sde2Q8K1J5 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Sde2Q8K1J5 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Sde2Q8K1J5 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Sde2Q8K1J5 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Sde2Q8K1J5 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Sde2Q8K1J5 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Sde2Q8K1J5 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Sde2Q8K1J5 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Sde2Q8K1J5 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Sde2Q8K1J5 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Sde2Q8K1J5 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Sde2Q8K1J5 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Sde2Q8K1J5 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Sde2Q8K1J5 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Sde2Q8K1J5 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Sde2Q8K1J5 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Sde2Q8K1J5 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Sde2Q8K1J5 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Sde2Q8K1J5 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Sde2Q8K1J5 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Sde2Q8K1J5 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Sde2Q8K1J5 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Sde2Q8K1J5 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Sde2Q8K1J5 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Sde2Q8K1J5 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Sde2Q8K1J5 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Sde2Q8K1J5 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Sde2Q8K1J5 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Sde2Q8K1J5 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Sde2Q8K1J5 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Sde2Q8K1J5 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Sde2Q8K1J5 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Sde2Q8K1J5 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Sde2Q8K1J5 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Sde2Q8K1J5 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Sde2Q8K1J5 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Sde2Q8K1J5 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Sde2Q8K1J5 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Sde2Q8K1J5 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Sde2Q8K1J5 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Sde2Q8K1J5 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Sde2Q8K1J5 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Sde2Q8K1J5 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
Sde2Q8K1J5 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Sde2Q8K1J5 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Sde2Q8K1J5 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Sde2Q8K1J5 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Sde2Q8K1J5 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Sde2Q8K1J5 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Sde2Q8K1J5 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Sde2Q8K1J5 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Sde2Q8K1J5 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Sde2Q8K1J5 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Sde2Q8K1J5 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Sde2Q8K1J5 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Sde2Q8K1J5 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Sde2Q8K1J5 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Sde2Q8K1J5 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Sde2Q8K1J5 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Sde2Q8K1J5 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Sde2Q8K1J5 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Sde2Q8K1J5 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Sde2Q8K1J5 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms