Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0D2

Habp2, Hyaluronan-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Habp2Q8K0D2 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Habp2Q8K0D2 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Habp2Q8K0D2 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Habp2Q8K0D2 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Habp2Q8K0D2 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Habp2Q8K0D2 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Habp2Q8K0D2 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Habp2Q8K0D2 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Habp2Q8K0D2 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Habp2Q8K0D2 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Habp2Q8K0D2 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Habp2Q8K0D2 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Habp2Q8K0D2 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Habp2Q8K0D2 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Habp2Q8K0D2 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Habp2Q8K0D2 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Habp2Q8K0D2 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Habp2Q8K0D2 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Habp2Q8K0D2 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Habp2Q8K0D2 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Habp2Q8K0D2 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Habp2Q8K0D2 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Habp2Q8K0D2 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Habp2Q8K0D2 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Habp2Q8K0D2 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Habp2Q8K0D2 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Habp2Q8K0D2 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Habp2Q8K0D2 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Habp2Q8K0D2 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Habp2Q8K0D2 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Habp2Q8K0D2 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Habp2Q8K0D2 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Habp2Q8K0D2 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Habp2Q8K0D2 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Habp2Q8K0D2 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Habp2Q8K0D2 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Habp2Q8K0D2 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Habp2Q8K0D2 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Habp2Q8K0D2 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Habp2Q8K0D2 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Habp2Q8K0D2 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Habp2Q8K0D2 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Habp2Q8K0D2 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Habp2Q8K0D2 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Habp2Q8K0D2 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Habp2Q8K0D2 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Habp2Q8K0D2 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Habp2Q8K0D2 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Habp2Q8K0D2 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Habp2Q8K0D2 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Habp2Q8K0D2 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Habp2Q8K0D2 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Habp2Q8K0D2 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Habp2Q8K0D2 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Habp2Q8K0D2 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Habp2Q8K0D2 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Habp2Q8K0D2 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Habp2Q8K0D2 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Habp2Q8K0D2 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Habp2Q8K0D2 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Habp2Q8K0D2 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Habp2Q8K0D2 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Habp2Q8K0D2 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Habp2Q8K0D2 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Habp2Q8K0D2 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Habp2Q8K0D2 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Habp2Q8K0D2 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Habp2Q8K0D2 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Habp2Q8K0D2 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Habp2Q8K0D2 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Habp2Q8K0D2 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Habp2Q8K0D2 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Habp2Q8K0D2 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Habp2Q8K0D2 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Habp2Q8K0D2 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Habp2Q8K0D2 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Habp2Q8K0D2 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Habp2Q8K0D2 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Habp2Q8K0D2 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Habp2Q8K0D2 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Habp2Q8K0D2 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Habp2Q8K0D2 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Habp2Q8K0D2 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Habp2Q8K0D2 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Habp2Q8K0D2 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Habp2Q8K0D2 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Habp2Q8K0D2 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Habp2Q8K0D2 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Habp2Q8K0D2 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Habp2Q8K0D2 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Habp2Q8K0D2 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Habp2Q8K0D2 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Habp2Q8K0D2 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Habp2Q8K0D2 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Habp2Q8K0D2 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Habp2Q8K0D2 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Habp2Q8K0D2 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Habp2Q8K0D2 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Habp2Q8K0D2 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Habp2Q8K0D2 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms