Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZW5

Sh2d5, SH2 domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh2d5Q8JZW5 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sh2d5Q8JZW5 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sh2d5Q8JZW5 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sh2d5Q8JZW5 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sh2d5Q8JZW5 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Sh2d5Q8JZW5 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sh2d5Q8JZW5 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sh2d5Q8JZW5 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sh2d5Q8JZW5 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sh2d5Q8JZW5 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sh2d5Q8JZW5 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sh2d5Q8JZW5 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Sh2d5Q8JZW5 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sh2d5Q8JZW5 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sh2d5Q8JZW5 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sh2d5Q8JZW5 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sh2d5Q8JZW5 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sh2d5Q8JZW5 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sh2d5Q8JZW5 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sh2d5Q8JZW5 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sh2d5Q8JZW5 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sh2d5Q8JZW5 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sh2d5Q8JZW5 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sh2d5Q8JZW5 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sh2d5Q8JZW5 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sh2d5Q8JZW5 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sh2d5Q8JZW5 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sh2d5Q8JZW5 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sh2d5Q8JZW5 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sh2d5Q8JZW5 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sh2d5Q8JZW5 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sh2d5Q8JZW5 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sh2d5Q8JZW5 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sh2d5Q8JZW5 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sh2d5Q8JZW5 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sh2d5Q8JZW5 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sh2d5Q8JZW5 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sh2d5Q8JZW5 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sh2d5Q8JZW5 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Sh2d5Q8JZW5 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sh2d5Q8JZW5 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Sh2d5Q8JZW5 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sh2d5Q8JZW5 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sh2d5Q8JZW5 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sh2d5Q8JZW5 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sh2d5Q8JZW5 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sh2d5Q8JZW5 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sh2d5Q8JZW5 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sh2d5Q8JZW5 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sh2d5Q8JZW5 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Sh2d5Q8JZW5 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sh2d5Q8JZW5 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Sh2d5Q8JZW5 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sh2d5Q8JZW5 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Sh2d5Q8JZW5 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Sh2d5Q8JZW5 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Sh2d5Q8JZW5 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sh2d5Q8JZW5 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Sh2d5Q8JZW5 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sh2d5Q8JZW5 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sh2d5Q8JZW5 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sh2d5Q8JZW5 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sh2d5Q8JZW5 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sh2d5Q8JZW5 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sh2d5Q8JZW5 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sh2d5Q8JZW5 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sh2d5Q8JZW5 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sh2d5Q8JZW5 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sh2d5Q8JZW5 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sh2d5Q8JZW5 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sh2d5Q8JZW5 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sh2d5Q8JZW5 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sh2d5Q8JZW5 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sh2d5Q8JZW5 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sh2d5Q8JZW5 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sh2d5Q8JZW5 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Sh2d5Q8JZW5 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Sh2d5Q8JZW5 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sh2d5Q8JZW5 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sh2d5Q8JZW5 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sh2d5Q8JZW5 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sh2d5Q8JZW5 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sh2d5Q8JZW5 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Sh2d5Q8JZW5 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sh2d5Q8JZW5 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sh2d5Q8JZW5 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sh2d5Q8JZW5 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sh2d5Q8JZW5 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Sh2d5Q8JZW5 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sh2d5Q8JZW5 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Sh2d5Q8JZW5 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sh2d5Q8JZW5 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sh2d5Q8JZW5 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sh2d5Q8JZW5 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sh2d5Q8JZW5 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sh2d5Q8JZW5 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sh2d5Q8JZW5 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sh2d5Q8JZW5 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sh2d5Q8JZW5 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sh2d5Q8JZW5 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms