Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZK6

Trim61, MCG22896, isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim61Q8JZK6 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trim61Q8JZK6 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trim61Q8JZK6 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Trim61Q8JZK6 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Trim61Q8JZK6 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Trim61Q8JZK6 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Trim61Q8JZK6 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Trim61Q8JZK6 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trim61Q8JZK6 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trim61Q8JZK6 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trim61Q8JZK6 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trim61Q8JZK6 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trim61Q8JZK6 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trim61Q8JZK6 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trim61Q8JZK6 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Trim61Q8JZK6 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trim61Q8JZK6 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trim61Q8JZK6 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trim61Q8JZK6 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trim61Q8JZK6 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trim61Q8JZK6 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trim61Q8JZK6 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trim61Q8JZK6 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trim61Q8JZK6 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trim61Q8JZK6 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trim61Q8JZK6 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trim61Q8JZK6 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trim61Q8JZK6 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trim61Q8JZK6 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trim61Q8JZK6 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trim61Q8JZK6 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trim61Q8JZK6 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trim61Q8JZK6 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trim61Q8JZK6 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trim61Q8JZK6 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trim61Q8JZK6 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trim61Q8JZK6 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trim61Q8JZK6 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trim61Q8JZK6 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trim61Q8JZK6 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trim61Q8JZK6 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trim61Q8JZK6 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trim61Q8JZK6 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trim61Q8JZK6 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trim61Q8JZK6 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Trim61Q8JZK6 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Trim61Q8JZK6 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Trim61Q8JZK6 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Trim61Q8JZK6 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Trim61Q8JZK6 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trim61Q8JZK6 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Trim61Q8JZK6 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Trim61Q8JZK6 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Trim61Q8JZK6 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trim61Q8JZK6 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trim61Q8JZK6 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trim61Q8JZK6 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Trim61Q8JZK6 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Trim61Q8JZK6 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Trim61Q8JZK6 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Trim61Q8JZK6 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Trim61Q8JZK6 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trim61Q8JZK6 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trim61Q8JZK6 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Trim61Q8JZK6 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Trim61Q8JZK6 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Trim61Q8JZK6 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Trim61Q8JZK6 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trim61Q8JZK6 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Trim61Q8JZK6 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Trim61Q8JZK6 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Trim61Q8JZK6 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Trim61Q8JZK6 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Trim61Q8JZK6 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Trim61Q8JZK6 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Trim61Q8JZK6 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Trim61Q8JZK6 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Trim61Q8JZK6 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Trim61Q8JZK6 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Trim61Q8JZK6 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Trim61Q8JZK6 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Trim61Q8JZK6 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Trim61Q8JZK6 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Trim61Q8JZK6 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Trim61Q8JZK6 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Trim61Q8JZK6 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Trim61Q8JZK6 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Trim61Q8JZK6 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Trim61Q8JZK6 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Trim61Q8JZK6 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Trim61Q8JZK6 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trim61Q8JZK6 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trim61Q8JZK6 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Trim61Q8JZK6 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trim61Q8JZK6 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trim61Q8JZK6 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Trim61Q8JZK6 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trim61Q8JZK6 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trim61Q8JZK6 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trim61Q8JZK6 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.4 ms