Protein–RNA interactions for Protein: Q8CI71

Vps50, Syndetin, mousemouse

Predictions only

Length 964 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps50Q8CI71 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Vps50Q8CI71 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Vps50Q8CI71 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Vps50Q8CI71 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Vps50Q8CI71 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Vps50Q8CI71 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Vps50Q8CI71 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Vps50Q8CI71 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Vps50Q8CI71 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Vps50Q8CI71 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Vps50Q8CI71 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Vps50Q8CI71 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Vps50Q8CI71 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Vps50Q8CI71 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Vps50Q8CI71 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vps50Q8CI71 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vps50Q8CI71 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vps50Q8CI71 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vps50Q8CI71 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Vps50Q8CI71 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Vps50Q8CI71 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Vps50Q8CI71 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Vps50Q8CI71 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Vps50Q8CI71 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Vps50Q8CI71 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Vps50Q8CI71 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Vps50Q8CI71 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Vps50Q8CI71 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Vps50Q8CI71 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Vps50Q8CI71 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Vps50Q8CI71 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Vps50Q8CI71 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Vps50Q8CI71 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Vps50Q8CI71 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Vps50Q8CI71 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Vps50Q8CI71 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Vps50Q8CI71 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Vps50Q8CI71 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Vps50Q8CI71 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Vps50Q8CI71 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Vps50Q8CI71 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Vps50Q8CI71 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Vps50Q8CI71 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Vps50Q8CI71 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Vps50Q8CI71 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Vps50Q8CI71 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Vps50Q8CI71 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Vps50Q8CI71 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Vps50Q8CI71 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Vps50Q8CI71 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Vps50Q8CI71 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Vps50Q8CI71 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Vps50Q8CI71 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Vps50Q8CI71 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Vps50Q8CI71 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Vps50Q8CI71 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Vps50Q8CI71 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Vps50Q8CI71 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Vps50Q8CI71 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Vps50Q8CI71 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Vps50Q8CI71 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Vps50Q8CI71 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Vps50Q8CI71 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Vps50Q8CI71 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Vps50Q8CI71 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Vps50Q8CI71 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Vps50Q8CI71 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Vps50Q8CI71 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Vps50Q8CI71 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Vps50Q8CI71 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Vps50Q8CI71 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Vps50Q8CI71 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Vps50Q8CI71 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Vps50Q8CI71 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Vps50Q8CI71 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Vps50Q8CI71 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Vps50Q8CI71 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Vps50Q8CI71 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Vps50Q8CI71 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Vps50Q8CI71 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Vps50Q8CI71 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Vps50Q8CI71 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Vps50Q8CI71 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Vps50Q8CI71 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Vps50Q8CI71 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Vps50Q8CI71 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Vps50Q8CI71 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Vps50Q8CI71 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Vps50Q8CI71 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Vps50Q8CI71 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Vps50Q8CI71 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Vps50Q8CI71 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Vps50Q8CI71 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Vps50Q8CI71 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Vps50Q8CI71 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Vps50Q8CI71 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Vps50Q8CI71 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Vps50Q8CI71 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Vps50Q8CI71 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Vps50Q8CI71 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms