Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEL2

Cfap61, Cilia- and flagella-associated protein 61, mousemouse

Predictions only

Length 1,252 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap61Q8CEL2 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cfap61Q8CEL2 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cfap61Q8CEL2 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cfap61Q8CEL2 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cfap61Q8CEL2 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Cfap61Q8CEL2 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cfap61Q8CEL2 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cfap61Q8CEL2 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cfap61Q8CEL2 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cfap61Q8CEL2 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cfap61Q8CEL2 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cfap61Q8CEL2 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cfap61Q8CEL2 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cfap61Q8CEL2 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cfap61Q8CEL2 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cfap61Q8CEL2 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cfap61Q8CEL2 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cfap61Q8CEL2 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cfap61Q8CEL2 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cfap61Q8CEL2 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cfap61Q8CEL2 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cfap61Q8CEL2 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cfap61Q8CEL2 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cfap61Q8CEL2 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cfap61Q8CEL2 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cfap61Q8CEL2 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cfap61Q8CEL2 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cfap61Q8CEL2 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cfap61Q8CEL2 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cfap61Q8CEL2 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cfap61Q8CEL2 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cfap61Q8CEL2 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cfap61Q8CEL2 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cfap61Q8CEL2 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cfap61Q8CEL2 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Cfap61Q8CEL2 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cfap61Q8CEL2 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cfap61Q8CEL2 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cfap61Q8CEL2 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cfap61Q8CEL2 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cfap61Q8CEL2 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cfap61Q8CEL2 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cfap61Q8CEL2 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cfap61Q8CEL2 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cfap61Q8CEL2 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cfap61Q8CEL2 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cfap61Q8CEL2 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cfap61Q8CEL2 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Cfap61Q8CEL2 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cfap61Q8CEL2 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cfap61Q8CEL2 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cfap61Q8CEL2 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cfap61Q8CEL2 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cfap61Q8CEL2 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cfap61Q8CEL2 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cfap61Q8CEL2 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cfap61Q8CEL2 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cfap61Q8CEL2 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cfap61Q8CEL2 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cfap61Q8CEL2 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cfap61Q8CEL2 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cfap61Q8CEL2 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cfap61Q8CEL2 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cfap61Q8CEL2 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cfap61Q8CEL2 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cfap61Q8CEL2 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cfap61Q8CEL2 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cfap61Q8CEL2 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cfap61Q8CEL2 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cfap61Q8CEL2 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cfap61Q8CEL2 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cfap61Q8CEL2 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Cfap61Q8CEL2 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cfap61Q8CEL2 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cfap61Q8CEL2 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cfap61Q8CEL2 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Cfap61Q8CEL2 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Cfap61Q8CEL2 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cfap61Q8CEL2 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cfap61Q8CEL2 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cfap61Q8CEL2 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cfap61Q8CEL2 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cfap61Q8CEL2 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cfap61Q8CEL2 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cfap61Q8CEL2 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Cfap61Q8CEL2 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cfap61Q8CEL2 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cfap61Q8CEL2 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Cfap61Q8CEL2 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cfap61Q8CEL2 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cfap61Q8CEL2 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cfap61Q8CEL2 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cfap61Q8CEL2 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cfap61Q8CEL2 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cfap61Q8CEL2 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cfap61Q8CEL2 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cfap61Q8CEL2 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cfap61Q8CEL2 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cfap61Q8CEL2 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cfap61Q8CEL2 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms