Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDW1

Fam228a, Protein FAM228A, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam228aQ8CDW1 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Fam228aQ8CDW1 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Fam228aQ8CDW1 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Fam228aQ8CDW1 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Fam228aQ8CDW1 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Fam228aQ8CDW1 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Fam228aQ8CDW1 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Fam228aQ8CDW1 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Fam228aQ8CDW1 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Fam228aQ8CDW1 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Fam228aQ8CDW1 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Fam228aQ8CDW1 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Fam228aQ8CDW1 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Fam228aQ8CDW1 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Fam228aQ8CDW1 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Fam228aQ8CDW1 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Fam228aQ8CDW1 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Fam228aQ8CDW1 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Fam228aQ8CDW1 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Fam228aQ8CDW1 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Fam228aQ8CDW1 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Fam228aQ8CDW1 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Fam228aQ8CDW1 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Fam228aQ8CDW1 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Fam228aQ8CDW1 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Fam228aQ8CDW1 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Fam228aQ8CDW1 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Fam228aQ8CDW1 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Fam228aQ8CDW1 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Fam228aQ8CDW1 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Fam228aQ8CDW1 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Fam228aQ8CDW1 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Fam228aQ8CDW1 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Fam228aQ8CDW1 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Fam228aQ8CDW1 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Fam228aQ8CDW1 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Fam228aQ8CDW1 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Fam228aQ8CDW1 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Fam228aQ8CDW1 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Fam228aQ8CDW1 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Fam228aQ8CDW1 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Fam228aQ8CDW1 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Fam228aQ8CDW1 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Fam228aQ8CDW1 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Fam228aQ8CDW1 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Fam228aQ8CDW1 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Fam228aQ8CDW1 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Fam228aQ8CDW1 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Fam228aQ8CDW1 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Fam228aQ8CDW1 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Fam228aQ8CDW1 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Fam228aQ8CDW1 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Fam228aQ8CDW1 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Fam228aQ8CDW1 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Fam228aQ8CDW1 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Fam228aQ8CDW1 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Fam228aQ8CDW1 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Fam228aQ8CDW1 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Fam228aQ8CDW1 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Fam228aQ8CDW1 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Fam228aQ8CDW1 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Fam228aQ8CDW1 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Fam228aQ8CDW1 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Fam228aQ8CDW1 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Fam228aQ8CDW1 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Fam228aQ8CDW1 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Fam228aQ8CDW1 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Fam228aQ8CDW1 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Fam228aQ8CDW1 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Fam228aQ8CDW1 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Fam228aQ8CDW1 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Fam228aQ8CDW1 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Fam228aQ8CDW1 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Fam228aQ8CDW1 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Fam228aQ8CDW1 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Fam228aQ8CDW1 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Fam228aQ8CDW1 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Fam228aQ8CDW1 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Fam228aQ8CDW1 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Fam228aQ8CDW1 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Fam228aQ8CDW1 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Fam228aQ8CDW1 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Fam228aQ8CDW1 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Fam228aQ8CDW1 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Fam228aQ8CDW1 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Fam228aQ8CDW1 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Fam228aQ8CDW1 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Fam228aQ8CDW1 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Fam228aQ8CDW1 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Fam228aQ8CDW1 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Fam228aQ8CDW1 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Fam228aQ8CDW1 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Fam228aQ8CDW1 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Fam228aQ8CDW1 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Fam228aQ8CDW1 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Fam228aQ8CDW1 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Fam228aQ8CDW1 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Fam228aQ8CDW1 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Fam228aQ8CDW1 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Fam228aQ8CDW1 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.5 ms