Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDN1

Uncharacterized protein C3orf20 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 933 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8CDN1 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Q8CDN1 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Q8CDN1 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Q8CDN1 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Q8CDN1 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Q8CDN1 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Q8CDN1 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Q8CDN1 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Q8CDN1 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Q8CDN1 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Q8CDN1 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Q8CDN1 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Q8CDN1 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Q8CDN1 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Q8CDN1 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Q8CDN1 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Q8CDN1 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Q8CDN1 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Q8CDN1 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Q8CDN1 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Q8CDN1 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Q8CDN1 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Q8CDN1 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Q8CDN1 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Q8CDN1 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Q8CDN1 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Q8CDN1 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Q8CDN1 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Q8CDN1 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Q8CDN1 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Q8CDN1 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Q8CDN1 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Q8CDN1 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Q8CDN1 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Q8CDN1 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Q8CDN1 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Q8CDN1 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Q8CDN1 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Q8CDN1 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Q8CDN1 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Q8CDN1 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Q8CDN1 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Q8CDN1 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Q8CDN1 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Q8CDN1 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Q8CDN1 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Q8CDN1 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Q8CDN1 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Q8CDN1 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Q8CDN1 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Q8CDN1 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Q8CDN1 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Q8CDN1 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Q8CDN1 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Q8CDN1 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Q8CDN1 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Q8CDN1 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Q8CDN1 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Q8CDN1 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Q8CDN1 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Q8CDN1 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Q8CDN1 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Q8CDN1 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Q8CDN1 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Q8CDN1 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Q8CDN1 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Q8CDN1 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Q8CDN1 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Q8CDN1 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Q8CDN1 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Q8CDN1 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Q8CDN1 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Q8CDN1 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Q8CDN1 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Q8CDN1 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Q8CDN1 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Q8CDN1 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Q8CDN1 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Q8CDN1 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Q8CDN1 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Q8CDN1 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Q8CDN1 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Q8CDN1 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Q8CDN1 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Q8CDN1 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Q8CDN1 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Q8CDN1 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Q8CDN1 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Q8CDN1 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Q8CDN1 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Q8CDN1 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Q8CDN1 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Q8CDN1 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Q8CDN1 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Q8CDN1 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Q8CDN1 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Q8CDN1 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Q8CDN1 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Q8CDN1 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Q8CDN1 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms