Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDF7

Exd1, piRNA biogenesis protein EXD1, mousemouse

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exd1Q8CDF7 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Exd1Q8CDF7 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Exd1Q8CDF7 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Exd1Q8CDF7 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Exd1Q8CDF7 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Exd1Q8CDF7 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Exd1Q8CDF7 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Exd1Q8CDF7 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Exd1Q8CDF7 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Exd1Q8CDF7 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Exd1Q8CDF7 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Exd1Q8CDF7 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Exd1Q8CDF7 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Exd1Q8CDF7 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Exd1Q8CDF7 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Exd1Q8CDF7 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Exd1Q8CDF7 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Exd1Q8CDF7 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Exd1Q8CDF7 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Exd1Q8CDF7 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Exd1Q8CDF7 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Exd1Q8CDF7 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Exd1Q8CDF7 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Exd1Q8CDF7 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Exd1Q8CDF7 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Exd1Q8CDF7 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Exd1Q8CDF7 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Exd1Q8CDF7 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Exd1Q8CDF7 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Exd1Q8CDF7 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Exd1Q8CDF7 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Exd1Q8CDF7 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Exd1Q8CDF7 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Exd1Q8CDF7 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Exd1Q8CDF7 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Exd1Q8CDF7 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Exd1Q8CDF7 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Exd1Q8CDF7 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Exd1Q8CDF7 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Exd1Q8CDF7 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Exd1Q8CDF7 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Exd1Q8CDF7 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Exd1Q8CDF7 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Exd1Q8CDF7 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Exd1Q8CDF7 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Exd1Q8CDF7 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Exd1Q8CDF7 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Exd1Q8CDF7 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Exd1Q8CDF7 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Exd1Q8CDF7 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Exd1Q8CDF7 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Exd1Q8CDF7 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Exd1Q8CDF7 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Exd1Q8CDF7 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Exd1Q8CDF7 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Exd1Q8CDF7 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Exd1Q8CDF7 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Exd1Q8CDF7 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Exd1Q8CDF7 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Exd1Q8CDF7 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Exd1Q8CDF7 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Exd1Q8CDF7 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Exd1Q8CDF7 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Exd1Q8CDF7 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Exd1Q8CDF7 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Exd1Q8CDF7 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Exd1Q8CDF7 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Exd1Q8CDF7 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Exd1Q8CDF7 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Exd1Q8CDF7 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Exd1Q8CDF7 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Exd1Q8CDF7 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Exd1Q8CDF7 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Exd1Q8CDF7 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Exd1Q8CDF7 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Exd1Q8CDF7 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Exd1Q8CDF7 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Exd1Q8CDF7 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Exd1Q8CDF7 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Exd1Q8CDF7 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Exd1Q8CDF7 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Exd1Q8CDF7 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Exd1Q8CDF7 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Exd1Q8CDF7 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Exd1Q8CDF7 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Exd1Q8CDF7 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Exd1Q8CDF7 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Exd1Q8CDF7 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Exd1Q8CDF7 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Exd1Q8CDF7 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Exd1Q8CDF7 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Exd1Q8CDF7 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Exd1Q8CDF7 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Exd1Q8CDF7 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Exd1Q8CDF7 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Exd1Q8CDF7 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Exd1Q8CDF7 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Exd1Q8CDF7 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Exd1Q8CDF7 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Exd1Q8CDF7 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms