Protein–RNA interactions for Protein: Q8CB67

Lrp11, Low-density lipoprotein receptor-related protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 483 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrp11Q8CB67 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lrp11Q8CB67 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lrp11Q8CB67 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lrp11Q8CB67 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lrp11Q8CB67 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lrp11Q8CB67 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lrp11Q8CB67 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lrp11Q8CB67 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lrp11Q8CB67 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lrp11Q8CB67 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lrp11Q8CB67 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lrp11Q8CB67 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lrp11Q8CB67 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lrp11Q8CB67 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lrp11Q8CB67 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lrp11Q8CB67 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lrp11Q8CB67 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lrp11Q8CB67 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lrp11Q8CB67 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lrp11Q8CB67 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lrp11Q8CB67 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Lrp11Q8CB67 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lrp11Q8CB67 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lrp11Q8CB67 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lrp11Q8CB67 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lrp11Q8CB67 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lrp11Q8CB67 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lrp11Q8CB67 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lrp11Q8CB67 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lrp11Q8CB67 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lrp11Q8CB67 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Lrp11Q8CB67 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Lrp11Q8CB67 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Lrp11Q8CB67 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Lrp11Q8CB67 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Lrp11Q8CB67 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Lrp11Q8CB67 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Lrp11Q8CB67 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lrp11Q8CB67 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lrp11Q8CB67 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lrp11Q8CB67 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lrp11Q8CB67 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lrp11Q8CB67 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lrp11Q8CB67 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lrp11Q8CB67 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lrp11Q8CB67 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lrp11Q8CB67 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lrp11Q8CB67 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lrp11Q8CB67 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lrp11Q8CB67 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lrp11Q8CB67 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lrp11Q8CB67 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lrp11Q8CB67 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lrp11Q8CB67 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lrp11Q8CB67 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lrp11Q8CB67 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lrp11Q8CB67 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Lrp11Q8CB67 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Lrp11Q8CB67 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Lrp11Q8CB67 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Lrp11Q8CB67 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Lrp11Q8CB67 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lrp11Q8CB67 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lrp11Q8CB67 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lrp11Q8CB67 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lrp11Q8CB67 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lrp11Q8CB67 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lrp11Q8CB67 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lrp11Q8CB67 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lrp11Q8CB67 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lrp11Q8CB67 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lrp11Q8CB67 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Lrp11Q8CB67 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lrp11Q8CB67 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lrp11Q8CB67 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lrp11Q8CB67 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lrp11Q8CB67 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lrp11Q8CB67 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lrp11Q8CB67 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lrp11Q8CB67 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lrp11Q8CB67 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lrp11Q8CB67 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lrp11Q8CB67 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lrp11Q8CB67 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lrp11Q8CB67 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lrp11Q8CB67 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lrp11Q8CB67 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lrp11Q8CB67 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lrp11Q8CB67 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Lrp11Q8CB67 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lrp11Q8CB67 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lrp11Q8CB67 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lrp11Q8CB67 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lrp11Q8CB67 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lrp11Q8CB67 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lrp11Q8CB67 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lrp11Q8CB67 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lrp11Q8CB67 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lrp11Q8CB67 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lrp11Q8CB67 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms