Protein–RNA interactions for Protein: Q8C8U0

Ppfibp1, Liprin-beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 969 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfibp1Q8C8U0 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Ppfibp1Q8C8U0 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ppfibp1Q8C8U0 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ppfibp1Q8C8U0 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ppfibp1Q8C8U0 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ppfibp1Q8C8U0 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ppfibp1Q8C8U0 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ppfibp1Q8C8U0 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ppfibp1Q8C8U0 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ppfibp1Q8C8U0 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ppfibp1Q8C8U0 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ppfibp1Q8C8U0 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ppfibp1Q8C8U0 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ppfibp1Q8C8U0 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Ppfibp1Q8C8U0 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ppfibp1Q8C8U0 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ppfibp1Q8C8U0 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ppfibp1Q8C8U0 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ppfibp1Q8C8U0 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ppfibp1Q8C8U0 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ppfibp1Q8C8U0 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ppfibp1Q8C8U0 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ppfibp1Q8C8U0 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ppfibp1Q8C8U0 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ppfibp1Q8C8U0 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ppfibp1Q8C8U0 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ppfibp1Q8C8U0 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ppfibp1Q8C8U0 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ppfibp1Q8C8U0 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ppfibp1Q8C8U0 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ppfibp1Q8C8U0 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Ppfibp1Q8C8U0 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Ppfibp1Q8C8U0 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ppfibp1Q8C8U0 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ppfibp1Q8C8U0 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ppfibp1Q8C8U0 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ppfibp1Q8C8U0 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ppfibp1Q8C8U0 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ppfibp1Q8C8U0 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ppfibp1Q8C8U0 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ppfibp1Q8C8U0 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ppfibp1Q8C8U0 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ppfibp1Q8C8U0 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ppfibp1Q8C8U0 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ppfibp1Q8C8U0 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ppfibp1Q8C8U0 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Ppfibp1Q8C8U0 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ppfibp1Q8C8U0 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ppfibp1Q8C8U0 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ppfibp1Q8C8U0 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Ppfibp1Q8C8U0 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ppfibp1Q8C8U0 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ppfibp1Q8C8U0 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ppfibp1Q8C8U0 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ppfibp1Q8C8U0 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ppfibp1Q8C8U0 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ppfibp1Q8C8U0 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ppfibp1Q8C8U0 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ppfibp1Q8C8U0 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ppfibp1Q8C8U0 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ppfibp1Q8C8U0 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ppfibp1Q8C8U0 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ppfibp1Q8C8U0 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Ppfibp1Q8C8U0 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ppfibp1Q8C8U0 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ppfibp1Q8C8U0 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ppfibp1Q8C8U0 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ppfibp1Q8C8U0 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ppfibp1Q8C8U0 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ppfibp1Q8C8U0 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ppfibp1Q8C8U0 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Ppfibp1Q8C8U0 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ppfibp1Q8C8U0 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ppfibp1Q8C8U0 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ppfibp1Q8C8U0 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ppfibp1Q8C8U0 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
Ppfibp1Q8C8U0 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ppfibp1Q8C8U0 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ppfibp1Q8C8U0 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ppfibp1Q8C8U0 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ppfibp1Q8C8U0 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ppfibp1Q8C8U0 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ppfibp1Q8C8U0 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ppfibp1Q8C8U0 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ppfibp1Q8C8U0 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ppfibp1Q8C8U0 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ppfibp1Q8C8U0 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Ppfibp1Q8C8U0 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ppfibp1Q8C8U0 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ppfibp1Q8C8U0 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ppfibp1Q8C8U0 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ppfibp1Q8C8U0 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ppfibp1Q8C8U0 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ppfibp1Q8C8U0 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ppfibp1Q8C8U0 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ppfibp1Q8C8U0 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ppfibp1Q8C8U0 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ppfibp1Q8C8U0 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ppfibp1Q8C8U0 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Ppfibp1Q8C8U0 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms