Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5U0

4933409G03Rik, RIKEN cDNA 4933409G03 gene, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933409G03RikQ8C5U0 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
4933409G03RikQ8C5U0 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
4933409G03RikQ8C5U0 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
4933409G03RikQ8C5U0 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
4933409G03RikQ8C5U0 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
4933409G03RikQ8C5U0 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
4933409G03RikQ8C5U0 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
4933409G03RikQ8C5U0 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
4933409G03RikQ8C5U0 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
4933409G03RikQ8C5U0 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
4933409G03RikQ8C5U0 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
4933409G03RikQ8C5U0 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
4933409G03RikQ8C5U0 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
4933409G03RikQ8C5U0 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
4933409G03RikQ8C5U0 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
4933409G03RikQ8C5U0 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
4933409G03RikQ8C5U0 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
4933409G03RikQ8C5U0 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
4933409G03RikQ8C5U0 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
4933409G03RikQ8C5U0 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
4933409G03RikQ8C5U0 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
4933409G03RikQ8C5U0 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
4933409G03RikQ8C5U0 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
4933409G03RikQ8C5U0 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
4933409G03RikQ8C5U0 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
4933409G03RikQ8C5U0 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
4933409G03RikQ8C5U0 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
4933409G03RikQ8C5U0 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
4933409G03RikQ8C5U0 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
4933409G03RikQ8C5U0 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
4933409G03RikQ8C5U0 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
4933409G03RikQ8C5U0 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
4933409G03RikQ8C5U0 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
4933409G03RikQ8C5U0 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
4933409G03RikQ8C5U0 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
4933409G03RikQ8C5U0 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
4933409G03RikQ8C5U0 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
4933409G03RikQ8C5U0 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
4933409G03RikQ8C5U0 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
4933409G03RikQ8C5U0 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
4933409G03RikQ8C5U0 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
4933409G03RikQ8C5U0 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
4933409G03RikQ8C5U0 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
4933409G03RikQ8C5U0 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
4933409G03RikQ8C5U0 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
4933409G03RikQ8C5U0 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
4933409G03RikQ8C5U0 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
4933409G03RikQ8C5U0 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
4933409G03RikQ8C5U0 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
4933409G03RikQ8C5U0 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
4933409G03RikQ8C5U0 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
4933409G03RikQ8C5U0 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
4933409G03RikQ8C5U0 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
4933409G03RikQ8C5U0 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
4933409G03RikQ8C5U0 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
4933409G03RikQ8C5U0 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
4933409G03RikQ8C5U0 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
4933409G03RikQ8C5U0 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
4933409G03RikQ8C5U0 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
4933409G03RikQ8C5U0 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
4933409G03RikQ8C5U0 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
4933409G03RikQ8C5U0 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
4933409G03RikQ8C5U0 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
4933409G03RikQ8C5U0 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
4933409G03RikQ8C5U0 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
4933409G03RikQ8C5U0 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
4933409G03RikQ8C5U0 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
4933409G03RikQ8C5U0 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
4933409G03RikQ8C5U0 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
4933409G03RikQ8C5U0 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
4933409G03RikQ8C5U0 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
4933409G03RikQ8C5U0 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
4933409G03RikQ8C5U0 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
4933409G03RikQ8C5U0 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
4933409G03RikQ8C5U0 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
4933409G03RikQ8C5U0 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
4933409G03RikQ8C5U0 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
4933409G03RikQ8C5U0 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
4933409G03RikQ8C5U0 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
4933409G03RikQ8C5U0 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
4933409G03RikQ8C5U0 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
4933409G03RikQ8C5U0 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
4933409G03RikQ8C5U0 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
4933409G03RikQ8C5U0 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
4933409G03RikQ8C5U0 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
4933409G03RikQ8C5U0 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
4933409G03RikQ8C5U0 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
4933409G03RikQ8C5U0 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
4933409G03RikQ8C5U0 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
4933409G03RikQ8C5U0 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
4933409G03RikQ8C5U0 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
4933409G03RikQ8C5U0 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
4933409G03RikQ8C5U0 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
4933409G03RikQ8C5U0 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
4933409G03RikQ8C5U0 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
4933409G03RikQ8C5U0 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
4933409G03RikQ8C5U0 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
4933409G03RikQ8C5U0 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
4933409G03RikQ8C5U0 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
4933409G03RikQ8C5U0 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.2 ms