Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXA6

Cldn17, Claudin-17, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn17Q8BXA6 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cldn17Q8BXA6 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cldn17Q8BXA6 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cldn17Q8BXA6 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cldn17Q8BXA6 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cldn17Q8BXA6 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cldn17Q8BXA6 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cldn17Q8BXA6 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Cldn17Q8BXA6 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cldn17Q8BXA6 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Cldn17Q8BXA6 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cldn17Q8BXA6 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cldn17Q8BXA6 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cldn17Q8BXA6 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cldn17Q8BXA6 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cldn17Q8BXA6 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cldn17Q8BXA6 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cldn17Q8BXA6 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Cldn17Q8BXA6 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Cldn17Q8BXA6 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cldn17Q8BXA6 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cldn17Q8BXA6 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cldn17Q8BXA6 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cldn17Q8BXA6 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cldn17Q8BXA6 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cldn17Q8BXA6 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cldn17Q8BXA6 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cldn17Q8BXA6 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
Cldn17Q8BXA6 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cldn17Q8BXA6 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cldn17Q8BXA6 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cldn17Q8BXA6 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cldn17Q8BXA6 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Cldn17Q8BXA6 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cldn17Q8BXA6 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cldn17Q8BXA6 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cldn17Q8BXA6 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cldn17Q8BXA6 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cldn17Q8BXA6 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cldn17Q8BXA6 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Cldn17Q8BXA6 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Cldn17Q8BXA6 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Cldn17Q8BXA6 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Cldn17Q8BXA6 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cldn17Q8BXA6 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cldn17Q8BXA6 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cldn17Q8BXA6 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cldn17Q8BXA6 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cldn17Q8BXA6 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cldn17Q8BXA6 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cldn17Q8BXA6 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cldn17Q8BXA6 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cldn17Q8BXA6 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Cldn17Q8BXA6 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cldn17Q8BXA6 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Cldn17Q8BXA6 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cldn17Q8BXA6 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cldn17Q8BXA6 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cldn17Q8BXA6 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cldn17Q8BXA6 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Cldn17Q8BXA6 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Cldn17Q8BXA6 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cldn17Q8BXA6 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cldn17Q8BXA6 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cldn17Q8BXA6 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cldn17Q8BXA6 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cldn17Q8BXA6 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cldn17Q8BXA6 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cldn17Q8BXA6 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cldn17Q8BXA6 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cldn17Q8BXA6 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cldn17Q8BXA6 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cldn17Q8BXA6 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cldn17Q8BXA6 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cldn17Q8BXA6 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cldn17Q8BXA6 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cldn17Q8BXA6 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cldn17Q8BXA6 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cldn17Q8BXA6 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cldn17Q8BXA6 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cldn17Q8BXA6 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cldn17Q8BXA6 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cldn17Q8BXA6 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cldn17Q8BXA6 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Cldn17Q8BXA6 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cldn17Q8BXA6 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cldn17Q8BXA6 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cldn17Q8BXA6 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cldn17Q8BXA6 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cldn17Q8BXA6 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cldn17Q8BXA6 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cldn17Q8BXA6 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cldn17Q8BXA6 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cldn17Q8BXA6 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cldn17Q8BXA6 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cldn17Q8BXA6 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cldn17Q8BXA6 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cldn17Q8BXA6 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cldn17Q8BXA6 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cldn17Q8BXA6 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms