Protein–RNA interactions for Protein: Q8BRN9

Cc2d1b, Coiled-coil and C2 domain-containing protein 1B, mousemouse

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cc2d1bQ8BRN9 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cc2d1bQ8BRN9 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cc2d1bQ8BRN9 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cc2d1bQ8BRN9 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cc2d1bQ8BRN9 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cc2d1bQ8BRN9 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cc2d1bQ8BRN9 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cc2d1bQ8BRN9 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cc2d1bQ8BRN9 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cc2d1bQ8BRN9 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cc2d1bQ8BRN9 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cc2d1bQ8BRN9 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cc2d1bQ8BRN9 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cc2d1bQ8BRN9 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Cc2d1bQ8BRN9 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cc2d1bQ8BRN9 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Cc2d1bQ8BRN9 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cc2d1bQ8BRN9 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cc2d1bQ8BRN9 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cc2d1bQ8BRN9 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cc2d1bQ8BRN9 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cc2d1bQ8BRN9 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cc2d1bQ8BRN9 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cc2d1bQ8BRN9 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cc2d1bQ8BRN9 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cc2d1bQ8BRN9 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cc2d1bQ8BRN9 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Cc2d1bQ8BRN9 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Cc2d1bQ8BRN9 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cc2d1bQ8BRN9 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cc2d1bQ8BRN9 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cc2d1bQ8BRN9 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cc2d1bQ8BRN9 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cc2d1bQ8BRN9 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Cc2d1bQ8BRN9 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cc2d1bQ8BRN9 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cc2d1bQ8BRN9 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cc2d1bQ8BRN9 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cc2d1bQ8BRN9 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cc2d1bQ8BRN9 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cc2d1bQ8BRN9 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cc2d1bQ8BRN9 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cc2d1bQ8BRN9 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cc2d1bQ8BRN9 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cc2d1bQ8BRN9 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cc2d1bQ8BRN9 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cc2d1bQ8BRN9 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cc2d1bQ8BRN9 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cc2d1bQ8BRN9 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cc2d1bQ8BRN9 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cc2d1bQ8BRN9 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cc2d1bQ8BRN9 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cc2d1bQ8BRN9 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cc2d1bQ8BRN9 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cc2d1bQ8BRN9 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cc2d1bQ8BRN9 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cc2d1bQ8BRN9 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cc2d1bQ8BRN9 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cc2d1bQ8BRN9 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cc2d1bQ8BRN9 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Cc2d1bQ8BRN9 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Cc2d1bQ8BRN9 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Cc2d1bQ8BRN9 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Cc2d1bQ8BRN9 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Cc2d1bQ8BRN9 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cc2d1bQ8BRN9 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cc2d1bQ8BRN9 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Cc2d1bQ8BRN9 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cc2d1bQ8BRN9 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cc2d1bQ8BRN9 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cc2d1bQ8BRN9 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cc2d1bQ8BRN9 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Cc2d1bQ8BRN9 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cc2d1bQ8BRN9 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cc2d1bQ8BRN9 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cc2d1bQ8BRN9 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cc2d1bQ8BRN9 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cc2d1bQ8BRN9 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cc2d1bQ8BRN9 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cc2d1bQ8BRN9 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cc2d1bQ8BRN9 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Cc2d1bQ8BRN9 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cc2d1bQ8BRN9 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cc2d1bQ8BRN9 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Cc2d1bQ8BRN9 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cc2d1bQ8BRN9 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cc2d1bQ8BRN9 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cc2d1bQ8BRN9 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Cc2d1bQ8BRN9 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cc2d1bQ8BRN9 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cc2d1bQ8BRN9 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cc2d1bQ8BRN9 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cc2d1bQ8BRN9 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cc2d1bQ8BRN9 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cc2d1bQ8BRN9 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cc2d1bQ8BRN9 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cc2d1bQ8BRN9 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cc2d1bQ8BRN9 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cc2d1bQ8BRN9 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cc2d1bQ8BRN9 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 103.3 ms