Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKV1

Gpc2, Glypican-2, mousemouse

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc2Q8BKV1 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gpc2Q8BKV1 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gpc2Q8BKV1 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Gpc2Q8BKV1 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Gpc2Q8BKV1 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Gpc2Q8BKV1 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Gpc2Q8BKV1 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Gpc2Q8BKV1 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Gpc2Q8BKV1 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gpc2Q8BKV1 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Gpc2Q8BKV1 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gpc2Q8BKV1 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Gpc2Q8BKV1 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gpc2Q8BKV1 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gpc2Q8BKV1 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Gpc2Q8BKV1 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Gpc2Q8BKV1 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Gpc2Q8BKV1 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Gpc2Q8BKV1 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Gpc2Q8BKV1 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Gpc2Q8BKV1 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Gpc2Q8BKV1 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Gpc2Q8BKV1 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Gpc2Q8BKV1 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gpc2Q8BKV1 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gpc2Q8BKV1 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Gpc2Q8BKV1 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gpc2Q8BKV1 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gpc2Q8BKV1 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gpc2Q8BKV1 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Gpc2Q8BKV1 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Gpc2Q8BKV1 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Gpc2Q8BKV1 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Gpc2Q8BKV1 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Gpc2Q8BKV1 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Gpc2Q8BKV1 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Gpc2Q8BKV1 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gpc2Q8BKV1 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gpc2Q8BKV1 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Gpc2Q8BKV1 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Gpc2Q8BKV1 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Gpc2Q8BKV1 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Gpc2Q8BKV1 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Gpc2Q8BKV1 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Gpc2Q8BKV1 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gpc2Q8BKV1 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gpc2Q8BKV1 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gpc2Q8BKV1 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gpc2Q8BKV1 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Gpc2Q8BKV1 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Gpc2Q8BKV1 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Gpc2Q8BKV1 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gpc2Q8BKV1 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gpc2Q8BKV1 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gpc2Q8BKV1 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gpc2Q8BKV1 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Gpc2Q8BKV1 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gpc2Q8BKV1 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gpc2Q8BKV1 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Gpc2Q8BKV1 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Gpc2Q8BKV1 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Gpc2Q8BKV1 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Gpc2Q8BKV1 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Gpc2Q8BKV1 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Gpc2Q8BKV1 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Gpc2Q8BKV1 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Gpc2Q8BKV1 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Gpc2Q8BKV1 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Gpc2Q8BKV1 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Gpc2Q8BKV1 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gpc2Q8BKV1 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gpc2Q8BKV1 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gpc2Q8BKV1 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gpc2Q8BKV1 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gpc2Q8BKV1 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gpc2Q8BKV1 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gpc2Q8BKV1 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gpc2Q8BKV1 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gpc2Q8BKV1 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Gpc2Q8BKV1 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Gpc2Q8BKV1 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gpc2Q8BKV1 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gpc2Q8BKV1 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gpc2Q8BKV1 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gpc2Q8BKV1 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gpc2Q8BKV1 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Gpc2Q8BKV1 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Gpc2Q8BKV1 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Gpc2Q8BKV1 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Gpc2Q8BKV1 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Gpc2Q8BKV1 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Gpc2Q8BKV1 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gpc2Q8BKV1 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gpc2Q8BKV1 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Gpc2Q8BKV1 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gpc2Q8BKV1 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Gpc2Q8BKV1 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gpc2Q8BKV1 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Gpc2Q8BKV1 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gpc2Q8BKV1 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.9 ms