Protein–RNA interactions for Protein: Q8BII1

Prox2, Prospero homeobox protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prox2Q8BII1 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Prox2Q8BII1 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Prox2Q8BII1 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Prox2Q8BII1 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Prox2Q8BII1 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Prox2Q8BII1 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Prox2Q8BII1 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Prox2Q8BII1 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Prox2Q8BII1 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Prox2Q8BII1 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Prox2Q8BII1 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Prox2Q8BII1 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Prox2Q8BII1 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Prox2Q8BII1 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Prox2Q8BII1 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Prox2Q8BII1 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Prox2Q8BII1 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Prox2Q8BII1 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Prox2Q8BII1 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Prox2Q8BII1 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Prox2Q8BII1 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Prox2Q8BII1 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Prox2Q8BII1 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Prox2Q8BII1 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Prox2Q8BII1 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Prox2Q8BII1 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Prox2Q8BII1 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Prox2Q8BII1 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Prox2Q8BII1 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Prox2Q8BII1 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Prox2Q8BII1 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Prox2Q8BII1 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Prox2Q8BII1 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Prox2Q8BII1 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Prox2Q8BII1 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Prox2Q8BII1 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Prox2Q8BII1 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Prox2Q8BII1 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Prox2Q8BII1 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Prox2Q8BII1 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Prox2Q8BII1 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Prox2Q8BII1 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Prox2Q8BII1 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Prox2Q8BII1 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Prox2Q8BII1 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Prox2Q8BII1 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Prox2Q8BII1 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Prox2Q8BII1 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Prox2Q8BII1 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Prox2Q8BII1 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Prox2Q8BII1 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Prox2Q8BII1 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Prox2Q8BII1 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Prox2Q8BII1 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Prox2Q8BII1 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Prox2Q8BII1 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Prox2Q8BII1 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Prox2Q8BII1 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Prox2Q8BII1 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Prox2Q8BII1 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Prox2Q8BII1 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Prox2Q8BII1 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Prox2Q8BII1 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Prox2Q8BII1 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Prox2Q8BII1 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Prox2Q8BII1 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Prox2Q8BII1 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Prox2Q8BII1 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Prox2Q8BII1 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Prox2Q8BII1 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Prox2Q8BII1 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Prox2Q8BII1 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Prox2Q8BII1 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Prox2Q8BII1 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Prox2Q8BII1 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Prox2Q8BII1 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Prox2Q8BII1 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Prox2Q8BII1 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Prox2Q8BII1 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Prox2Q8BII1 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Prox2Q8BII1 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Prox2Q8BII1 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Prox2Q8BII1 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Prox2Q8BII1 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Prox2Q8BII1 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Prox2Q8BII1 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Prox2Q8BII1 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Prox2Q8BII1 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Prox2Q8BII1 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Prox2Q8BII1 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Prox2Q8BII1 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Prox2Q8BII1 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Prox2Q8BII1 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Prox2Q8BII1 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Prox2Q8BII1 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Prox2Q8BII1 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Prox2Q8BII1 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Prox2Q8BII1 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Prox2Q8BII1 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Prox2Q8BII1 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms