Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG28

B3galnt2, UDP-GalNAc:beta-1,3-N-acetylgalactosaminyltransferase 2, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B3galnt2Q8BG28 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
B3galnt2Q8BG28 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
B3galnt2Q8BG28 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
B3galnt2Q8BG28 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
B3galnt2Q8BG28 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
B3galnt2Q8BG28 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
B3galnt2Q8BG28 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
B3galnt2Q8BG28 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
B3galnt2Q8BG28 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
B3galnt2Q8BG28 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
B3galnt2Q8BG28 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
B3galnt2Q8BG28 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
B3galnt2Q8BG28 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
B3galnt2Q8BG28 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
B3galnt2Q8BG28 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
B3galnt2Q8BG28 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
B3galnt2Q8BG28 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
B3galnt2Q8BG28 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
B3galnt2Q8BG28 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
B3galnt2Q8BG28 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
B3galnt2Q8BG28 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
B3galnt2Q8BG28 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
B3galnt2Q8BG28 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
B3galnt2Q8BG28 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
B3galnt2Q8BG28 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
B3galnt2Q8BG28 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
B3galnt2Q8BG28 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
B3galnt2Q8BG28 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
B3galnt2Q8BG28 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
B3galnt2Q8BG28 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
B3galnt2Q8BG28 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
B3galnt2Q8BG28 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
B3galnt2Q8BG28 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
B3galnt2Q8BG28 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
B3galnt2Q8BG28 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
B3galnt2Q8BG28 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
B3galnt2Q8BG28 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
B3galnt2Q8BG28 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
B3galnt2Q8BG28 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
B3galnt2Q8BG28 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
B3galnt2Q8BG28 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
B3galnt2Q8BG28 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
B3galnt2Q8BG28 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
B3galnt2Q8BG28 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
B3galnt2Q8BG28 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
B3galnt2Q8BG28 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
B3galnt2Q8BG28 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
B3galnt2Q8BG28 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
B3galnt2Q8BG28 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
B3galnt2Q8BG28 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
B3galnt2Q8BG28 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
B3galnt2Q8BG28 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
B3galnt2Q8BG28 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
B3galnt2Q8BG28 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
B3galnt2Q8BG28 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
B3galnt2Q8BG28 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
B3galnt2Q8BG28 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
B3galnt2Q8BG28 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
B3galnt2Q8BG28 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
B3galnt2Q8BG28 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
B3galnt2Q8BG28 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
B3galnt2Q8BG28 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
B3galnt2Q8BG28 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
B3galnt2Q8BG28 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
B3galnt2Q8BG28 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
B3galnt2Q8BG28 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
B3galnt2Q8BG28 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
B3galnt2Q8BG28 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
B3galnt2Q8BG28 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
B3galnt2Q8BG28 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
B3galnt2Q8BG28 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
B3galnt2Q8BG28 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
B3galnt2Q8BG28 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
B3galnt2Q8BG28 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
B3galnt2Q8BG28 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
B3galnt2Q8BG28 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
B3galnt2Q8BG28 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
B3galnt2Q8BG28 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
B3galnt2Q8BG28 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
B3galnt2Q8BG28 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
B3galnt2Q8BG28 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
B3galnt2Q8BG28 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
B3galnt2Q8BG28 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
B3galnt2Q8BG28 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
B3galnt2Q8BG28 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
B3galnt2Q8BG28 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
B3galnt2Q8BG28 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
B3galnt2Q8BG28 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
B3galnt2Q8BG28 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
B3galnt2Q8BG28 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
B3galnt2Q8BG28 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
B3galnt2Q8BG28 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
B3galnt2Q8BG28 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
B3galnt2Q8BG28 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
B3galnt2Q8BG28 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
B3galnt2Q8BG28 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
B3galnt2Q8BG28 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
B3galnt2Q8BG28 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
B3galnt2Q8BG28 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
B3galnt2Q8BG28 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 268.1 ms