Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG07

Pld4, Phospholipase D4, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pld4Q8BG07 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pld4Q8BG07 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pld4Q8BG07 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pld4Q8BG07 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pld4Q8BG07 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pld4Q8BG07 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pld4Q8BG07 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pld4Q8BG07 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pld4Q8BG07 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pld4Q8BG07 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pld4Q8BG07 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Pld4Q8BG07 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pld4Q8BG07 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pld4Q8BG07 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pld4Q8BG07 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pld4Q8BG07 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pld4Q8BG07 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pld4Q8BG07 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pld4Q8BG07 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pld4Q8BG07 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pld4Q8BG07 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pld4Q8BG07 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pld4Q8BG07 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pld4Q8BG07 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pld4Q8BG07 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pld4Q8BG07 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Pld4Q8BG07 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pld4Q8BG07 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pld4Q8BG07 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pld4Q8BG07 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pld4Q8BG07 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pld4Q8BG07 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pld4Q8BG07 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pld4Q8BG07 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pld4Q8BG07 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pld4Q8BG07 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pld4Q8BG07 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pld4Q8BG07 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pld4Q8BG07 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Pld4Q8BG07 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pld4Q8BG07 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pld4Q8BG07 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pld4Q8BG07 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pld4Q8BG07 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pld4Q8BG07 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pld4Q8BG07 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pld4Q8BG07 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pld4Q8BG07 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pld4Q8BG07 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pld4Q8BG07 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pld4Q8BG07 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Pld4Q8BG07 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pld4Q8BG07 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pld4Q8BG07 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pld4Q8BG07 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pld4Q8BG07 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pld4Q8BG07 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pld4Q8BG07 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pld4Q8BG07 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Pld4Q8BG07 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Pld4Q8BG07 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pld4Q8BG07 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pld4Q8BG07 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pld4Q8BG07 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pld4Q8BG07 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pld4Q8BG07 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pld4Q8BG07 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pld4Q8BG07 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pld4Q8BG07 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pld4Q8BG07 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pld4Q8BG07 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pld4Q8BG07 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pld4Q8BG07 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pld4Q8BG07 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pld4Q8BG07 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pld4Q8BG07 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pld4Q8BG07 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pld4Q8BG07 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pld4Q8BG07 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pld4Q8BG07 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Pld4Q8BG07 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pld4Q8BG07 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pld4Q8BG07 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pld4Q8BG07 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pld4Q8BG07 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pld4Q8BG07 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pld4Q8BG07 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pld4Q8BG07 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pld4Q8BG07 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pld4Q8BG07 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pld4Q8BG07 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pld4Q8BG07 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pld4Q8BG07 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pld4Q8BG07 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pld4Q8BG07 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pld4Q8BG07 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pld4Q8BG07 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pld4Q8BG07 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pld4Q8BG07 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Pld4Q8BG07 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms