Protein–RNA interactions for Protein: Q810L4

Tmem39b, Transmembrane protein 39B, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem39bQ810L4 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Tmem39bQ810L4 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Tmem39bQ810L4 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Tmem39bQ810L4 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Tmem39bQ810L4 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Tmem39bQ810L4 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Tmem39bQ810L4 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Tmem39bQ810L4 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Tmem39bQ810L4 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Tmem39bQ810L4 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Tmem39bQ810L4 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Tmem39bQ810L4 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Tmem39bQ810L4 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Tmem39bQ810L4 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Tmem39bQ810L4 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Tmem39bQ810L4 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Tmem39bQ810L4 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Tmem39bQ810L4 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Tmem39bQ810L4 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Tmem39bQ810L4 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Tmem39bQ810L4 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Tmem39bQ810L4 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Tmem39bQ810L4 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Tmem39bQ810L4 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Tmem39bQ810L4 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Tmem39bQ810L4 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Tmem39bQ810L4 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Tmem39bQ810L4 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Tmem39bQ810L4 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Tmem39bQ810L4 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Tmem39bQ810L4 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Tmem39bQ810L4 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Tmem39bQ810L4 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Tmem39bQ810L4 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Tmem39bQ810L4 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Tmem39bQ810L4 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Tmem39bQ810L4 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Tmem39bQ810L4 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Tmem39bQ810L4 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Tmem39bQ810L4 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Tmem39bQ810L4 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Tmem39bQ810L4 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Tmem39bQ810L4 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Tmem39bQ810L4 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Tmem39bQ810L4 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Tmem39bQ810L4 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Tmem39bQ810L4 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Tmem39bQ810L4 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Tmem39bQ810L4 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Tmem39bQ810L4 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Tmem39bQ810L4 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Tmem39bQ810L4 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Tmem39bQ810L4 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Tmem39bQ810L4 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Tmem39bQ810L4 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Tmem39bQ810L4 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Tmem39bQ810L4 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Tmem39bQ810L4 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Tmem39bQ810L4 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Tmem39bQ810L4 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Tmem39bQ810L4 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Tmem39bQ810L4 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
Tmem39bQ810L4 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Tmem39bQ810L4 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Tmem39bQ810L4 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Tmem39bQ810L4 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Tmem39bQ810L4 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Tmem39bQ810L4 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Tmem39bQ810L4 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Tmem39bQ810L4 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Tmem39bQ810L4 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Tmem39bQ810L4 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Tmem39bQ810L4 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Tmem39bQ810L4 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
Tmem39bQ810L4 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Tmem39bQ810L4 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Tmem39bQ810L4 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Tmem39bQ810L4 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Tmem39bQ810L4 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Tmem39bQ810L4 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Tmem39bQ810L4 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Tmem39bQ810L4 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Tmem39bQ810L4 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
Tmem39bQ810L4 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Tmem39bQ810L4 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Tmem39bQ810L4 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Tmem39bQ810L4 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Tmem39bQ810L4 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Tmem39bQ810L4 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Tmem39bQ810L4 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Tmem39bQ810L4 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Tmem39bQ810L4 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Tmem39bQ810L4 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Tmem39bQ810L4 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Tmem39bQ810L4 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Tmem39bQ810L4 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Tmem39bQ810L4 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Tmem39bQ810L4 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Tmem39bQ810L4 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Tmem39bQ810L4 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.6 ms