Protein–RNA interactions for Protein: Q80U04

Pja2, E3 ubiquitin-protein ligase Praja-2, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pja2Q80U04 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pja2Q80U04 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pja2Q80U04 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pja2Q80U04 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pja2Q80U04 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pja2Q80U04 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pja2Q80U04 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pja2Q80U04 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pja2Q80U04 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pja2Q80U04 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pja2Q80U04 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pja2Q80U04 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pja2Q80U04 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pja2Q80U04 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pja2Q80U04 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pja2Q80U04 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pja2Q80U04 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pja2Q80U04 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pja2Q80U04 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pja2Q80U04 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pja2Q80U04 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pja2Q80U04 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pja2Q80U04 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pja2Q80U04 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pja2Q80U04 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pja2Q80U04 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pja2Q80U04 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pja2Q80U04 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pja2Q80U04 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pja2Q80U04 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pja2Q80U04 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pja2Q80U04 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pja2Q80U04 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pja2Q80U04 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pja2Q80U04 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pja2Q80U04 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pja2Q80U04 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pja2Q80U04 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pja2Q80U04 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pja2Q80U04 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pja2Q80U04 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pja2Q80U04 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pja2Q80U04 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pja2Q80U04 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pja2Q80U04 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pja2Q80U04 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pja2Q80U04 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pja2Q80U04 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pja2Q80U04 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pja2Q80U04 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pja2Q80U04 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pja2Q80U04 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pja2Q80U04 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pja2Q80U04 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pja2Q80U04 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pja2Q80U04 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pja2Q80U04 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pja2Q80U04 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pja2Q80U04 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pja2Q80U04 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pja2Q80U04 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pja2Q80U04 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pja2Q80U04 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pja2Q80U04 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pja2Q80U04 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pja2Q80U04 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pja2Q80U04 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pja2Q80U04 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pja2Q80U04 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pja2Q80U04 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pja2Q80U04 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pja2Q80U04 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pja2Q80U04 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pja2Q80U04 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Pja2Q80U04 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Pja2Q80U04 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Pja2Q80U04 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Pja2Q80U04 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pja2Q80U04 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pja2Q80U04 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pja2Q80U04 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pja2Q80U04 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pja2Q80U04 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pja2Q80U04 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Pja2Q80U04 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pja2Q80U04 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pja2Q80U04 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pja2Q80U04 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pja2Q80U04 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pja2Q80U04 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pja2Q80U04 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pja2Q80U04 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Pja2Q80U04 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pja2Q80U04 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pja2Q80U04 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pja2Q80U04 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pja2Q80U04 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pja2Q80U04 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pja2Q80U04 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pja2Q80U04 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.3 ms