Protein–RNA interactions for Protein: Q80SS5

Ifna12, Interferon alpha-12, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna12Q80SS5 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ifna12Q80SS5 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ifna12Q80SS5 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ifna12Q80SS5 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ifna12Q80SS5 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ifna12Q80SS5 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ifna12Q80SS5 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ifna12Q80SS5 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ifna12Q80SS5 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ifna12Q80SS5 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ifna12Q80SS5 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Ifna12Q80SS5 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ifna12Q80SS5 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ifna12Q80SS5 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ifna12Q80SS5 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ifna12Q80SS5 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ifna12Q80SS5 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ifna12Q80SS5 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ifna12Q80SS5 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ifna12Q80SS5 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ifna12Q80SS5 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ifna12Q80SS5 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ifna12Q80SS5 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ifna12Q80SS5 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ifna12Q80SS5 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ifna12Q80SS5 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ifna12Q80SS5 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ifna12Q80SS5 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ifna12Q80SS5 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ifna12Q80SS5 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ifna12Q80SS5 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ifna12Q80SS5 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ifna12Q80SS5 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ifna12Q80SS5 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ifna12Q80SS5 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ifna12Q80SS5 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Ifna12Q80SS5 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ifna12Q80SS5 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ifna12Q80SS5 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ifna12Q80SS5 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ifna12Q80SS5 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ifna12Q80SS5 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ifna12Q80SS5 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ifna12Q80SS5 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ifna12Q80SS5 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ifna12Q80SS5 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ifna12Q80SS5 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ifna12Q80SS5 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ifna12Q80SS5 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ifna12Q80SS5 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ifna12Q80SS5 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ifna12Q80SS5 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ifna12Q80SS5 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ifna12Q80SS5 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ifna12Q80SS5 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ifna12Q80SS5 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Ifna12Q80SS5 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ifna12Q80SS5 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ifna12Q80SS5 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ifna12Q80SS5 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ifna12Q80SS5 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ifna12Q80SS5 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ifna12Q80SS5 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ifna12Q80SS5 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ifna12Q80SS5 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ifna12Q80SS5 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Ifna12Q80SS5 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ifna12Q80SS5 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ifna12Q80SS5 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ifna12Q80SS5 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ifna12Q80SS5 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ifna12Q80SS5 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ifna12Q80SS5 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ifna12Q80SS5 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ifna12Q80SS5 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ifna12Q80SS5 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ifna12Q80SS5 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ifna12Q80SS5 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ifna12Q80SS5 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ifna12Q80SS5 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ifna12Q80SS5 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ifna12Q80SS5 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ifna12Q80SS5 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ifna12Q80SS5 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ifna12Q80SS5 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ifna12Q80SS5 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ifna12Q80SS5 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ifna12Q80SS5 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ifna12Q80SS5 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ifna12Q80SS5 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ifna12Q80SS5 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ifna12Q80SS5 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ifna12Q80SS5 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ifna12Q80SS5 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ifna12Q80SS5 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ifna12Q80SS5 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ifna12Q80SS5 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ifna12Q80SS5 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Ifna12Q80SS5 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ifna12Q80SS5 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.9 ms