Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS74

Ckap2l, Cytoskeleton-associated protein 2-like, mousemouse

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap2lQ7TS74 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ckap2lQ7TS74 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ckap2lQ7TS74 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ckap2lQ7TS74 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ckap2lQ7TS74 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ckap2lQ7TS74 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ckap2lQ7TS74 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ckap2lQ7TS74 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ckap2lQ7TS74 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ckap2lQ7TS74 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ckap2lQ7TS74 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ckap2lQ7TS74 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ckap2lQ7TS74 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ckap2lQ7TS74 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ckap2lQ7TS74 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ckap2lQ7TS74 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ckap2lQ7TS74 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ckap2lQ7TS74 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ckap2lQ7TS74 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ckap2lQ7TS74 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ckap2lQ7TS74 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ckap2lQ7TS74 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ckap2lQ7TS74 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ckap2lQ7TS74 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ckap2lQ7TS74 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ckap2lQ7TS74 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ckap2lQ7TS74 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ckap2lQ7TS74 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ckap2lQ7TS74 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ckap2lQ7TS74 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ckap2lQ7TS74 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ckap2lQ7TS74 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ckap2lQ7TS74 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ckap2lQ7TS74 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ckap2lQ7TS74 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ckap2lQ7TS74 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ckap2lQ7TS74 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ckap2lQ7TS74 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ckap2lQ7TS74 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ckap2lQ7TS74 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ckap2lQ7TS74 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ckap2lQ7TS74 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ckap2lQ7TS74 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ckap2lQ7TS74 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Ckap2lQ7TS74 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ckap2lQ7TS74 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ckap2lQ7TS74 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ckap2lQ7TS74 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ckap2lQ7TS74 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ckap2lQ7TS74 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ckap2lQ7TS74 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ckap2lQ7TS74 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ckap2lQ7TS74 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Ckap2lQ7TS74 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ckap2lQ7TS74 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ckap2lQ7TS74 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Ckap2lQ7TS74 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ckap2lQ7TS74 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ckap2lQ7TS74 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ckap2lQ7TS74 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ckap2lQ7TS74 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ckap2lQ7TS74 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ckap2lQ7TS74 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Ckap2lQ7TS74 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ckap2lQ7TS74 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ckap2lQ7TS74 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ckap2lQ7TS74 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ckap2lQ7TS74 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ckap2lQ7TS74 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ckap2lQ7TS74 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ckap2lQ7TS74 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ckap2lQ7TS74 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ckap2lQ7TS74 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ckap2lQ7TS74 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ckap2lQ7TS74 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ckap2lQ7TS74 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Ckap2lQ7TS74 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ckap2lQ7TS74 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ckap2lQ7TS74 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ckap2lQ7TS74 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ckap2lQ7TS74 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ckap2lQ7TS74 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ckap2lQ7TS74 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ckap2lQ7TS74 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ckap2lQ7TS74 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ckap2lQ7TS74 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ckap2lQ7TS74 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ckap2lQ7TS74 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ckap2lQ7TS74 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ckap2lQ7TS74 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ckap2lQ7TS74 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Ckap2lQ7TS74 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Ckap2lQ7TS74 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Ckap2lQ7TS74 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ckap2lQ7TS74 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ckap2lQ7TS74 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ckap2lQ7TS74 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ckap2lQ7TS74 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ckap2lQ7TS74 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ckap2lQ7TS74 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.1 ms