Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNH6

Nphp3, Nephrocystin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp3Q7TNH6 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Nphp3Q7TNH6 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Nphp3Q7TNH6 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Nphp3Q7TNH6 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Nphp3Q7TNH6 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Nphp3Q7TNH6 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Nphp3Q7TNH6 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Nphp3Q7TNH6 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Nphp3Q7TNH6 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Nphp3Q7TNH6 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
Nphp3Q7TNH6 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Nphp3Q7TNH6 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Nphp3Q7TNH6 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Nphp3Q7TNH6 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Nphp3Q7TNH6 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Nphp3Q7TNH6 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Nphp3Q7TNH6 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Nphp3Q7TNH6 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Nphp3Q7TNH6 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Nphp3Q7TNH6 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Nphp3Q7TNH6 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Nphp3Q7TNH6 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Nphp3Q7TNH6 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Nphp3Q7TNH6 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Nphp3Q7TNH6 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Nphp3Q7TNH6 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Nphp3Q7TNH6 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Nphp3Q7TNH6 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Nphp3Q7TNH6 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Nphp3Q7TNH6 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Nphp3Q7TNH6 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Nphp3Q7TNH6 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Nphp3Q7TNH6 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Nphp3Q7TNH6 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Nphp3Q7TNH6 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Nphp3Q7TNH6 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Nphp3Q7TNH6 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Nphp3Q7TNH6 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Nphp3Q7TNH6 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Nphp3Q7TNH6 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Nphp3Q7TNH6 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Nphp3Q7TNH6 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Nphp3Q7TNH6 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Nphp3Q7TNH6 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Nphp3Q7TNH6 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
Nphp3Q7TNH6 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
Nphp3Q7TNH6 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Nphp3Q7TNH6 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
Nphp3Q7TNH6 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
Nphp3Q7TNH6 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Nphp3Q7TNH6 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Nphp3Q7TNH6 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Nphp3Q7TNH6 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Nphp3Q7TNH6 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Nphp3Q7TNH6 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Nphp3Q7TNH6 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Nphp3Q7TNH6 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Nphp3Q7TNH6 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Nphp3Q7TNH6 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Nphp3Q7TNH6 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Nphp3Q7TNH6 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Nphp3Q7TNH6 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Nphp3Q7TNH6 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Nphp3Q7TNH6 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Nphp3Q7TNH6 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Nphp3Q7TNH6 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Nphp3Q7TNH6 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Nphp3Q7TNH6 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Nphp3Q7TNH6 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Nphp3Q7TNH6 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Nphp3Q7TNH6 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Nphp3Q7TNH6 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Nphp3Q7TNH6 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
Nphp3Q7TNH6 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
Nphp3Q7TNH6 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Nphp3Q7TNH6 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Nphp3Q7TNH6 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Nphp3Q7TNH6 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Nphp3Q7TNH6 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Nphp3Q7TNH6 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Nphp3Q7TNH6 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Nphp3Q7TNH6 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Nphp3Q7TNH6 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Nphp3Q7TNH6 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Nphp3Q7TNH6 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Nphp3Q7TNH6 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Nphp3Q7TNH6 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Nphp3Q7TNH6 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Nphp3Q7TNH6 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Nphp3Q7TNH6 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Nphp3Q7TNH6 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Nphp3Q7TNH6 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Nphp3Q7TNH6 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Nphp3Q7TNH6 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Nphp3Q7TNH6 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Nphp3Q7TNH6 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Nphp3Q7TNH6 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Nphp3Q7TNH6 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Nphp3Q7TNH6 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Nphp3Q7TNH6 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms