Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWQ7

Spcs3, Signal peptidase complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spcs3Q6ZWQ7 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Spcs3Q6ZWQ7 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Spcs3Q6ZWQ7 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Spcs3Q6ZWQ7 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Spcs3Q6ZWQ7 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Spcs3Q6ZWQ7 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Spcs3Q6ZWQ7 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Spcs3Q6ZWQ7 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Spcs3Q6ZWQ7 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Spcs3Q6ZWQ7 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Spcs3Q6ZWQ7 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Spcs3Q6ZWQ7 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Spcs3Q6ZWQ7 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Spcs3Q6ZWQ7 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Spcs3Q6ZWQ7 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Spcs3Q6ZWQ7 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Spcs3Q6ZWQ7 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Spcs3Q6ZWQ7 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Spcs3Q6ZWQ7 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Spcs3Q6ZWQ7 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Spcs3Q6ZWQ7 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Spcs3Q6ZWQ7 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Spcs3Q6ZWQ7 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Spcs3Q6ZWQ7 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Spcs3Q6ZWQ7 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Spcs3Q6ZWQ7 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Spcs3Q6ZWQ7 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Spcs3Q6ZWQ7 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Spcs3Q6ZWQ7 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Spcs3Q6ZWQ7 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Spcs3Q6ZWQ7 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Spcs3Q6ZWQ7 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Spcs3Q6ZWQ7 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Spcs3Q6ZWQ7 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Spcs3Q6ZWQ7 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Spcs3Q6ZWQ7 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Spcs3Q6ZWQ7 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Spcs3Q6ZWQ7 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Spcs3Q6ZWQ7 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Spcs3Q6ZWQ7 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Spcs3Q6ZWQ7 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Spcs3Q6ZWQ7 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Spcs3Q6ZWQ7 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Spcs3Q6ZWQ7 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Spcs3Q6ZWQ7 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Spcs3Q6ZWQ7 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Spcs3Q6ZWQ7 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Spcs3Q6ZWQ7 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Spcs3Q6ZWQ7 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Spcs3Q6ZWQ7 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Spcs3Q6ZWQ7 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Spcs3Q6ZWQ7 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Spcs3Q6ZWQ7 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Spcs3Q6ZWQ7 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Spcs3Q6ZWQ7 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Spcs3Q6ZWQ7 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Spcs3Q6ZWQ7 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Spcs3Q6ZWQ7 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Spcs3Q6ZWQ7 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Spcs3Q6ZWQ7 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Spcs3Q6ZWQ7 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Spcs3Q6ZWQ7 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Spcs3Q6ZWQ7 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Spcs3Q6ZWQ7 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Spcs3Q6ZWQ7 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Spcs3Q6ZWQ7 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Spcs3Q6ZWQ7 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Spcs3Q6ZWQ7 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Spcs3Q6ZWQ7 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Spcs3Q6ZWQ7 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Spcs3Q6ZWQ7 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Spcs3Q6ZWQ7 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Spcs3Q6ZWQ7 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Spcs3Q6ZWQ7 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Spcs3Q6ZWQ7 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Spcs3Q6ZWQ7 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Spcs3Q6ZWQ7 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Spcs3Q6ZWQ7 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Spcs3Q6ZWQ7 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Spcs3Q6ZWQ7 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Spcs3Q6ZWQ7 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Spcs3Q6ZWQ7 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Spcs3Q6ZWQ7 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Spcs3Q6ZWQ7 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Spcs3Q6ZWQ7 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Spcs3Q6ZWQ7 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Spcs3Q6ZWQ7 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Spcs3Q6ZWQ7 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Spcs3Q6ZWQ7 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Spcs3Q6ZWQ7 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Spcs3Q6ZWQ7 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Spcs3Q6ZWQ7 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Spcs3Q6ZWQ7 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Spcs3Q6ZWQ7 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Spcs3Q6ZWQ7 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Spcs3Q6ZWQ7 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Spcs3Q6ZWQ7 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Spcs3Q6ZWQ7 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Spcs3Q6ZWQ7 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Spcs3Q6ZWQ7 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms