Protein–RNA interactions for Protein: Q6W5C0

Cxcl3, C-X-C motif chemokine 3, mousemouse

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl3Q6W5C0 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cxcl3Q6W5C0 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cxcl3Q6W5C0 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cxcl3Q6W5C0 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cxcl3Q6W5C0 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cxcl3Q6W5C0 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cxcl3Q6W5C0 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cxcl3Q6W5C0 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cxcl3Q6W5C0 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cxcl3Q6W5C0 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cxcl3Q6W5C0 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cxcl3Q6W5C0 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cxcl3Q6W5C0 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cxcl3Q6W5C0 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cxcl3Q6W5C0 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cxcl3Q6W5C0 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cxcl3Q6W5C0 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cxcl3Q6W5C0 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cxcl3Q6W5C0 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cxcl3Q6W5C0 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cxcl3Q6W5C0 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cxcl3Q6W5C0 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cxcl3Q6W5C0 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cxcl3Q6W5C0 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cxcl3Q6W5C0 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cxcl3Q6W5C0 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cxcl3Q6W5C0 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cxcl3Q6W5C0 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cxcl3Q6W5C0 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Cxcl3Q6W5C0 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Cxcl3Q6W5C0 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Cxcl3Q6W5C0 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Cxcl3Q6W5C0 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Cxcl3Q6W5C0 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Cxcl3Q6W5C0 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Cxcl3Q6W5C0 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Cxcl3Q6W5C0 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cxcl3Q6W5C0 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cxcl3Q6W5C0 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cxcl3Q6W5C0 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cxcl3Q6W5C0 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Cxcl3Q6W5C0 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cxcl3Q6W5C0 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cxcl3Q6W5C0 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cxcl3Q6W5C0 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cxcl3Q6W5C0 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cxcl3Q6W5C0 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cxcl3Q6W5C0 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cxcl3Q6W5C0 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cxcl3Q6W5C0 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cxcl3Q6W5C0 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cxcl3Q6W5C0 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cxcl3Q6W5C0 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cxcl3Q6W5C0 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cxcl3Q6W5C0 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cxcl3Q6W5C0 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cxcl3Q6W5C0 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cxcl3Q6W5C0 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cxcl3Q6W5C0 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cxcl3Q6W5C0 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cxcl3Q6W5C0 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cxcl3Q6W5C0 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Cxcl3Q6W5C0 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cxcl3Q6W5C0 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cxcl3Q6W5C0 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Cxcl3Q6W5C0 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cxcl3Q6W5C0 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cxcl3Q6W5C0 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cxcl3Q6W5C0 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cxcl3Q6W5C0 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cxcl3Q6W5C0 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Cxcl3Q6W5C0 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cxcl3Q6W5C0 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cxcl3Q6W5C0 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cxcl3Q6W5C0 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cxcl3Q6W5C0 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cxcl3Q6W5C0 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cxcl3Q6W5C0 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cxcl3Q6W5C0 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cxcl3Q6W5C0 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cxcl3Q6W5C0 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cxcl3Q6W5C0 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cxcl3Q6W5C0 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cxcl3Q6W5C0 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cxcl3Q6W5C0 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cxcl3Q6W5C0 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cxcl3Q6W5C0 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cxcl3Q6W5C0 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cxcl3Q6W5C0 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cxcl3Q6W5C0 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cxcl3Q6W5C0 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Cxcl3Q6W5C0 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cxcl3Q6W5C0 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cxcl3Q6W5C0 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cxcl3Q6W5C0 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cxcl3Q6W5C0 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cxcl3Q6W5C0 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cxcl3Q6W5C0 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cxcl3Q6W5C0 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cxcl3Q6W5C0 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms