Protein–RNA interactions for Protein: Q6VYH9

Hsh2d, Hematopoietic SH2 domain-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hsh2dQ6VYH9 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hsh2dQ6VYH9 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hsh2dQ6VYH9 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hsh2dQ6VYH9 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hsh2dQ6VYH9 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Hsh2dQ6VYH9 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hsh2dQ6VYH9 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hsh2dQ6VYH9 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hsh2dQ6VYH9 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hsh2dQ6VYH9 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hsh2dQ6VYH9 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hsh2dQ6VYH9 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Hsh2dQ6VYH9 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Hsh2dQ6VYH9 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Hsh2dQ6VYH9 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Hsh2dQ6VYH9 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Hsh2dQ6VYH9 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Hsh2dQ6VYH9 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Hsh2dQ6VYH9 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hsh2dQ6VYH9 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hsh2dQ6VYH9 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hsh2dQ6VYH9 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hsh2dQ6VYH9 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hsh2dQ6VYH9 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hsh2dQ6VYH9 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hsh2dQ6VYH9 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hsh2dQ6VYH9 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hsh2dQ6VYH9 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hsh2dQ6VYH9 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hsh2dQ6VYH9 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hsh2dQ6VYH9 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hsh2dQ6VYH9 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hsh2dQ6VYH9 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hsh2dQ6VYH9 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hsh2dQ6VYH9 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Hsh2dQ6VYH9 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hsh2dQ6VYH9 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hsh2dQ6VYH9 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hsh2dQ6VYH9 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hsh2dQ6VYH9 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hsh2dQ6VYH9 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hsh2dQ6VYH9 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hsh2dQ6VYH9 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hsh2dQ6VYH9 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hsh2dQ6VYH9 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hsh2dQ6VYH9 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hsh2dQ6VYH9 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hsh2dQ6VYH9 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hsh2dQ6VYH9 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Hsh2dQ6VYH9 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hsh2dQ6VYH9 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hsh2dQ6VYH9 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hsh2dQ6VYH9 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Hsh2dQ6VYH9 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Hsh2dQ6VYH9 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Hsh2dQ6VYH9 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hsh2dQ6VYH9 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hsh2dQ6VYH9 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hsh2dQ6VYH9 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hsh2dQ6VYH9 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hsh2dQ6VYH9 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hsh2dQ6VYH9 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hsh2dQ6VYH9 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hsh2dQ6VYH9 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hsh2dQ6VYH9 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hsh2dQ6VYH9 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hsh2dQ6VYH9 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hsh2dQ6VYH9 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hsh2dQ6VYH9 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hsh2dQ6VYH9 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hsh2dQ6VYH9 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hsh2dQ6VYH9 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Hsh2dQ6VYH9 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Hsh2dQ6VYH9 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Hsh2dQ6VYH9 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Hsh2dQ6VYH9 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Hsh2dQ6VYH9 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Hsh2dQ6VYH9 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Hsh2dQ6VYH9 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Hsh2dQ6VYH9 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Hsh2dQ6VYH9 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Hsh2dQ6VYH9 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Hsh2dQ6VYH9 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Hsh2dQ6VYH9 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Hsh2dQ6VYH9 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Hsh2dQ6VYH9 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Hsh2dQ6VYH9 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Hsh2dQ6VYH9 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Hsh2dQ6VYH9 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Hsh2dQ6VYH9 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hsh2dQ6VYH9 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hsh2dQ6VYH9 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hsh2dQ6VYH9 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hsh2dQ6VYH9 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Hsh2dQ6VYH9 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hsh2dQ6VYH9 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hsh2dQ6VYH9 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hsh2dQ6VYH9 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hsh2dQ6VYH9 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hsh2dQ6VYH9 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms