Protein–RNA interactions for Protein: Q6SJQ5

Cd300ld3, CMRF35-like molecule 3, mousemouse

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd300ld3Q6SJQ5 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cd300ld3Q6SJQ5 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cd300ld3Q6SJQ5 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cd300ld3Q6SJQ5 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Cd300ld3Q6SJQ5 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cd300ld3Q6SJQ5 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cd300ld3Q6SJQ5 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cd300ld3Q6SJQ5 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cd300ld3Q6SJQ5 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cd300ld3Q6SJQ5 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cd300ld3Q6SJQ5 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cd300ld3Q6SJQ5 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cd300ld3Q6SJQ5 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cd300ld3Q6SJQ5 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cd300ld3Q6SJQ5 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cd300ld3Q6SJQ5 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cd300ld3Q6SJQ5 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cd300ld3Q6SJQ5 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cd300ld3Q6SJQ5 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cd300ld3Q6SJQ5 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cd300ld3Q6SJQ5 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cd300ld3Q6SJQ5 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cd300ld3Q6SJQ5 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cd300ld3Q6SJQ5 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cd300ld3Q6SJQ5 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cd300ld3Q6SJQ5 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cd300ld3Q6SJQ5 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cd300ld3Q6SJQ5 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cd300ld3Q6SJQ5 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Cd300ld3Q6SJQ5 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cd300ld3Q6SJQ5 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Cd300ld3Q6SJQ5 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cd300ld3Q6SJQ5 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cd300ld3Q6SJQ5 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Cd300ld3Q6SJQ5 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Cd300ld3Q6SJQ5 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cd300ld3Q6SJQ5 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cd300ld3Q6SJQ5 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cd300ld3Q6SJQ5 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cd300ld3Q6SJQ5 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cd300ld3Q6SJQ5 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cd300ld3Q6SJQ5 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cd300ld3Q6SJQ5 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cd300ld3Q6SJQ5 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cd300ld3Q6SJQ5 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cd300ld3Q6SJQ5 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Cd300ld3Q6SJQ5 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cd300ld3Q6SJQ5 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cd300ld3Q6SJQ5 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cd300ld3Q6SJQ5 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cd300ld3Q6SJQ5 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cd300ld3Q6SJQ5 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cd300ld3Q6SJQ5 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cd300ld3Q6SJQ5 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cd300ld3Q6SJQ5 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cd300ld3Q6SJQ5 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cd300ld3Q6SJQ5 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cd300ld3Q6SJQ5 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cd300ld3Q6SJQ5 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cd300ld3Q6SJQ5 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cd300ld3Q6SJQ5 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cd300ld3Q6SJQ5 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cd300ld3Q6SJQ5 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Cd300ld3Q6SJQ5 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cd300ld3Q6SJQ5 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cd300ld3Q6SJQ5 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cd300ld3Q6SJQ5 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cd300ld3Q6SJQ5 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cd300ld3Q6SJQ5 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cd300ld3Q6SJQ5 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cd300ld3Q6SJQ5 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cd300ld3Q6SJQ5 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Cd300ld3Q6SJQ5 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cd300ld3Q6SJQ5 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cd300ld3Q6SJQ5 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Cd300ld3Q6SJQ5 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Cd300ld3Q6SJQ5 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Cd300ld3Q6SJQ5 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Cd300ld3Q6SJQ5 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Cd300ld3Q6SJQ5 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cd300ld3Q6SJQ5 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cd300ld3Q6SJQ5 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cd300ld3Q6SJQ5 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Cd300ld3Q6SJQ5 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cd300ld3Q6SJQ5 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Cd300ld3Q6SJQ5 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cd300ld3Q6SJQ5 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cd300ld3Q6SJQ5 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cd300ld3Q6SJQ5 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cd300ld3Q6SJQ5 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cd300ld3Q6SJQ5 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms