Protein–RNA interactions for Protein: Q6PGG2

Gmip, GEM-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 971 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GmipQ6PGG2 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GmipQ6PGG2 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GmipQ6PGG2 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GmipQ6PGG2 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GmipQ6PGG2 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GmipQ6PGG2 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GmipQ6PGG2 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GmipQ6PGG2 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GmipQ6PGG2 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GmipQ6PGG2 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GmipQ6PGG2 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GmipQ6PGG2 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GmipQ6PGG2 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GmipQ6PGG2 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GmipQ6PGG2 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GmipQ6PGG2 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GmipQ6PGG2 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GmipQ6PGG2 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GmipQ6PGG2 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GmipQ6PGG2 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GmipQ6PGG2 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GmipQ6PGG2 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
GmipQ6PGG2 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GmipQ6PGG2 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GmipQ6PGG2 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GmipQ6PGG2 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
GmipQ6PGG2 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GmipQ6PGG2 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GmipQ6PGG2 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
GmipQ6PGG2 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GmipQ6PGG2 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GmipQ6PGG2 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GmipQ6PGG2 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
GmipQ6PGG2 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GmipQ6PGG2 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GmipQ6PGG2 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GmipQ6PGG2 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GmipQ6PGG2 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GmipQ6PGG2 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GmipQ6PGG2 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GmipQ6PGG2 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GmipQ6PGG2 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GmipQ6PGG2 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GmipQ6PGG2 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GmipQ6PGG2 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GmipQ6PGG2 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GmipQ6PGG2 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GmipQ6PGG2 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GmipQ6PGG2 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GmipQ6PGG2 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GmipQ6PGG2 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GmipQ6PGG2 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GmipQ6PGG2 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GmipQ6PGG2 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GmipQ6PGG2 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GmipQ6PGG2 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GmipQ6PGG2 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GmipQ6PGG2 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GmipQ6PGG2 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GmipQ6PGG2 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GmipQ6PGG2 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GmipQ6PGG2 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GmipQ6PGG2 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GmipQ6PGG2 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GmipQ6PGG2 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GmipQ6PGG2 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GmipQ6PGG2 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GmipQ6PGG2 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GmipQ6PGG2 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
GmipQ6PGG2 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
GmipQ6PGG2 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
GmipQ6PGG2 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GmipQ6PGG2 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GmipQ6PGG2 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GmipQ6PGG2 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GmipQ6PGG2 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GmipQ6PGG2 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GmipQ6PGG2 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GmipQ6PGG2 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GmipQ6PGG2 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
GmipQ6PGG2 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GmipQ6PGG2 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GmipQ6PGG2 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GmipQ6PGG2 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GmipQ6PGG2 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GmipQ6PGG2 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GmipQ6PGG2 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GmipQ6PGG2 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GmipQ6PGG2 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
GmipQ6PGG2 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
GmipQ6PGG2 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GmipQ6PGG2 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GmipQ6PGG2 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GmipQ6PGG2 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GmipQ6PGG2 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GmipQ6PGG2 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GmipQ6PGG2 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GmipQ6PGG2 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GmipQ6PGG2 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GmipQ6PGG2 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.1 ms