Protein–RNA interactions for Protein: Q6PG04

Ccdc82, Coiled-coil domain-containing protein 82, mousemouse

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc82Q6PG04 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ccdc82Q6PG04 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ccdc82Q6PG04 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ccdc82Q6PG04 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ccdc82Q6PG04 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ccdc82Q6PG04 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ccdc82Q6PG04 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ccdc82Q6PG04 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ccdc82Q6PG04 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ccdc82Q6PG04 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ccdc82Q6PG04 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ccdc82Q6PG04 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ccdc82Q6PG04 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ccdc82Q6PG04 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ccdc82Q6PG04 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Ccdc82Q6PG04 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ccdc82Q6PG04 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ccdc82Q6PG04 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ccdc82Q6PG04 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ccdc82Q6PG04 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ccdc82Q6PG04 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ccdc82Q6PG04 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ccdc82Q6PG04 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ccdc82Q6PG04 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ccdc82Q6PG04 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ccdc82Q6PG04 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ccdc82Q6PG04 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ccdc82Q6PG04 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ccdc82Q6PG04 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ccdc82Q6PG04 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ccdc82Q6PG04 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ccdc82Q6PG04 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ccdc82Q6PG04 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ccdc82Q6PG04 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ccdc82Q6PG04 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ccdc82Q6PG04 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ccdc82Q6PG04 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ccdc82Q6PG04 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ccdc82Q6PG04 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ccdc82Q6PG04 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Ccdc82Q6PG04 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ccdc82Q6PG04 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ccdc82Q6PG04 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ccdc82Q6PG04 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ccdc82Q6PG04 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ccdc82Q6PG04 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ccdc82Q6PG04 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ccdc82Q6PG04 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ccdc82Q6PG04 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ccdc82Q6PG04 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ccdc82Q6PG04 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ccdc82Q6PG04 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ccdc82Q6PG04 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ccdc82Q6PG04 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ccdc82Q6PG04 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ccdc82Q6PG04 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Ccdc82Q6PG04 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Ccdc82Q6PG04 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Ccdc82Q6PG04 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ccdc82Q6PG04 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Ccdc82Q6PG04 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ccdc82Q6PG04 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ccdc82Q6PG04 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ccdc82Q6PG04 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ccdc82Q6PG04 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ccdc82Q6PG04 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ccdc82Q6PG04 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ccdc82Q6PG04 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Ccdc82Q6PG04 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ccdc82Q6PG04 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ccdc82Q6PG04 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ccdc82Q6PG04 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ccdc82Q6PG04 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ccdc82Q6PG04 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ccdc82Q6PG04 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ccdc82Q6PG04 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ccdc82Q6PG04 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Ccdc82Q6PG04 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ccdc82Q6PG04 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ccdc82Q6PG04 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ccdc82Q6PG04 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ccdc82Q6PG04 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ccdc82Q6PG04 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ccdc82Q6PG04 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ccdc82Q6PG04 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ccdc82Q6PG04 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC26.08■■□□□ 1.76
Ccdc82Q6PG04 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ccdc82Q6PG04 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ccdc82Q6PG04 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ccdc82Q6PG04 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Ccdc82Q6PG04 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ccdc82Q6PG04 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ccdc82Q6PG04 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ccdc82Q6PG04 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ccdc82Q6PG04 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ccdc82Q6PG04 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ccdc82Q6PG04 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ccdc82Q6PG04 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ccdc82Q6PG04 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ccdc82Q6PG04 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms