Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFY1

Fchsd1, F-BAR and double SH3 domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 688 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fchsd1Q6PFY1 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Fchsd1Q6PFY1 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Fchsd1Q6PFY1 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Fchsd1Q6PFY1 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Fchsd1Q6PFY1 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Fchsd1Q6PFY1 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Fchsd1Q6PFY1 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Fchsd1Q6PFY1 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Fchsd1Q6PFY1 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Fchsd1Q6PFY1 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Fchsd1Q6PFY1 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Fchsd1Q6PFY1 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Fchsd1Q6PFY1 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
Fchsd1Q6PFY1 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
Fchsd1Q6PFY1 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Fchsd1Q6PFY1 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Fchsd1Q6PFY1 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Fchsd1Q6PFY1 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Fchsd1Q6PFY1 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Fchsd1Q6PFY1 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Fchsd1Q6PFY1 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Fchsd1Q6PFY1 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Fchsd1Q6PFY1 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Fchsd1Q6PFY1 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Fchsd1Q6PFY1 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Fchsd1Q6PFY1 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Fchsd1Q6PFY1 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Fchsd1Q6PFY1 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Fchsd1Q6PFY1 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Fchsd1Q6PFY1 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Fchsd1Q6PFY1 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Fchsd1Q6PFY1 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Fchsd1Q6PFY1 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Fchsd1Q6PFY1 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Fchsd1Q6PFY1 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Fchsd1Q6PFY1 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Fchsd1Q6PFY1 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Fchsd1Q6PFY1 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Fchsd1Q6PFY1 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Fchsd1Q6PFY1 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Fchsd1Q6PFY1 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Fchsd1Q6PFY1 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Fchsd1Q6PFY1 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Fchsd1Q6PFY1 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Fchsd1Q6PFY1 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
Fchsd1Q6PFY1 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Fchsd1Q6PFY1 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Fchsd1Q6PFY1 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Fchsd1Q6PFY1 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Fchsd1Q6PFY1 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Fchsd1Q6PFY1 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Fchsd1Q6PFY1 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Fchsd1Q6PFY1 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Fchsd1Q6PFY1 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Fchsd1Q6PFY1 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Fchsd1Q6PFY1 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Fchsd1Q6PFY1 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Fchsd1Q6PFY1 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Fchsd1Q6PFY1 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Fchsd1Q6PFY1 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Fchsd1Q6PFY1 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Fchsd1Q6PFY1 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Fchsd1Q6PFY1 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Fchsd1Q6PFY1 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Fchsd1Q6PFY1 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Fchsd1Q6PFY1 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Fchsd1Q6PFY1 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Fchsd1Q6PFY1 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Fchsd1Q6PFY1 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Fchsd1Q6PFY1 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Fchsd1Q6PFY1 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Fchsd1Q6PFY1 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Fchsd1Q6PFY1 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Fchsd1Q6PFY1 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Fchsd1Q6PFY1 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Fchsd1Q6PFY1 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Fchsd1Q6PFY1 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Fchsd1Q6PFY1 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Fchsd1Q6PFY1 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Fchsd1Q6PFY1 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Fchsd1Q6PFY1 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Fchsd1Q6PFY1 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Fchsd1Q6PFY1 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Fchsd1Q6PFY1 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Fchsd1Q6PFY1 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Fchsd1Q6PFY1 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Fchsd1Q6PFY1 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Fchsd1Q6PFY1 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Fchsd1Q6PFY1 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Fchsd1Q6PFY1 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Fchsd1Q6PFY1 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Fchsd1Q6PFY1 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Fchsd1Q6PFY1 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Fchsd1Q6PFY1 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Fchsd1Q6PFY1 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Fchsd1Q6PFY1 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Fchsd1Q6PFY1 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Fchsd1Q6PFY1 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Fchsd1Q6PFY1 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Fchsd1Q6PFY1 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms