Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDC0

Rundc3b, RUN domain-containing protein 3B, mousemouse

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc3bQ6PDC0 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rundc3bQ6PDC0 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rundc3bQ6PDC0 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rundc3bQ6PDC0 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rundc3bQ6PDC0 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rundc3bQ6PDC0 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rundc3bQ6PDC0 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rundc3bQ6PDC0 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rundc3bQ6PDC0 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rundc3bQ6PDC0 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rundc3bQ6PDC0 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rundc3bQ6PDC0 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rundc3bQ6PDC0 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rundc3bQ6PDC0 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rundc3bQ6PDC0 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rundc3bQ6PDC0 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rundc3bQ6PDC0 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rundc3bQ6PDC0 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rundc3bQ6PDC0 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rundc3bQ6PDC0 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rundc3bQ6PDC0 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rundc3bQ6PDC0 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rundc3bQ6PDC0 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rundc3bQ6PDC0 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rundc3bQ6PDC0 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rundc3bQ6PDC0 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rundc3bQ6PDC0 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rundc3bQ6PDC0 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rundc3bQ6PDC0 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rundc3bQ6PDC0 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rundc3bQ6PDC0 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rundc3bQ6PDC0 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rundc3bQ6PDC0 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rundc3bQ6PDC0 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rundc3bQ6PDC0 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rundc3bQ6PDC0 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rundc3bQ6PDC0 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rundc3bQ6PDC0 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rundc3bQ6PDC0 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rundc3bQ6PDC0 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rundc3bQ6PDC0 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rundc3bQ6PDC0 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rundc3bQ6PDC0 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rundc3bQ6PDC0 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rundc3bQ6PDC0 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rundc3bQ6PDC0 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rundc3bQ6PDC0 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rundc3bQ6PDC0 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Rundc3bQ6PDC0 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rundc3bQ6PDC0 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rundc3bQ6PDC0 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Rundc3bQ6PDC0 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Rundc3bQ6PDC0 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rundc3bQ6PDC0 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rundc3bQ6PDC0 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rundc3bQ6PDC0 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rundc3bQ6PDC0 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rundc3bQ6PDC0 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rundc3bQ6PDC0 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rundc3bQ6PDC0 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rundc3bQ6PDC0 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rundc3bQ6PDC0 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rundc3bQ6PDC0 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rundc3bQ6PDC0 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rundc3bQ6PDC0 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rundc3bQ6PDC0 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rundc3bQ6PDC0 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rundc3bQ6PDC0 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rundc3bQ6PDC0 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rundc3bQ6PDC0 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rundc3bQ6PDC0 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rundc3bQ6PDC0 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rundc3bQ6PDC0 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rundc3bQ6PDC0 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rundc3bQ6PDC0 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rundc3bQ6PDC0 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rundc3bQ6PDC0 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rundc3bQ6PDC0 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rundc3bQ6PDC0 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rundc3bQ6PDC0 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Rundc3bQ6PDC0 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rundc3bQ6PDC0 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rundc3bQ6PDC0 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rundc3bQ6PDC0 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Rundc3bQ6PDC0 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Rundc3bQ6PDC0 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rundc3bQ6PDC0 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rundc3bQ6PDC0 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rundc3bQ6PDC0 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rundc3bQ6PDC0 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rundc3bQ6PDC0 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rundc3bQ6PDC0 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rundc3bQ6PDC0 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rundc3bQ6PDC0 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rundc3bQ6PDC0 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rundc3bQ6PDC0 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rundc3bQ6PDC0 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rundc3bQ6PDC0 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rundc3bQ6PDC0 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rundc3bQ6PDC0 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 141 ms