Protein–RNA interactions for Protein: Q6P6I6

Polr2m, DNA-directed RNA polymerase II subunit GRINL1A, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2mQ6P6I6 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Polr2mQ6P6I6 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Polr2mQ6P6I6 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Polr2mQ6P6I6 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Polr2mQ6P6I6 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Polr2mQ6P6I6 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Polr2mQ6P6I6 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Polr2mQ6P6I6 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Polr2mQ6P6I6 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Polr2mQ6P6I6 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Polr2mQ6P6I6 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Polr2mQ6P6I6 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Polr2mQ6P6I6 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Polr2mQ6P6I6 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Polr2mQ6P6I6 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Polr2mQ6P6I6 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Polr2mQ6P6I6 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Polr2mQ6P6I6 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Polr2mQ6P6I6 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Polr2mQ6P6I6 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Polr2mQ6P6I6 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Polr2mQ6P6I6 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Polr2mQ6P6I6 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Polr2mQ6P6I6 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Polr2mQ6P6I6 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Polr2mQ6P6I6 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Polr2mQ6P6I6 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Polr2mQ6P6I6 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Polr2mQ6P6I6 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Polr2mQ6P6I6 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Polr2mQ6P6I6 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Polr2mQ6P6I6 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Polr2mQ6P6I6 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Polr2mQ6P6I6 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Polr2mQ6P6I6 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Polr2mQ6P6I6 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Polr2mQ6P6I6 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Polr2mQ6P6I6 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Polr2mQ6P6I6 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Polr2mQ6P6I6 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Polr2mQ6P6I6 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Polr2mQ6P6I6 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Polr2mQ6P6I6 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Polr2mQ6P6I6 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Polr2mQ6P6I6 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Polr2mQ6P6I6 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Polr2mQ6P6I6 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Polr2mQ6P6I6 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Polr2mQ6P6I6 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Polr2mQ6P6I6 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Polr2mQ6P6I6 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Polr2mQ6P6I6 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Polr2mQ6P6I6 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Polr2mQ6P6I6 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Polr2mQ6P6I6 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Polr2mQ6P6I6 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Polr2mQ6P6I6 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Polr2mQ6P6I6 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Polr2mQ6P6I6 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Polr2mQ6P6I6 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Polr2mQ6P6I6 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Polr2mQ6P6I6 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Polr2mQ6P6I6 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Polr2mQ6P6I6 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Polr2mQ6P6I6 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Polr2mQ6P6I6 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Polr2mQ6P6I6 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Polr2mQ6P6I6 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Polr2mQ6P6I6 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Polr2mQ6P6I6 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Polr2mQ6P6I6 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Polr2mQ6P6I6 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Polr2mQ6P6I6 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Polr2mQ6P6I6 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Polr2mQ6P6I6 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Polr2mQ6P6I6 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Polr2mQ6P6I6 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Polr2mQ6P6I6 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Polr2mQ6P6I6 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Polr2mQ6P6I6 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Polr2mQ6P6I6 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Polr2mQ6P6I6 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Polr2mQ6P6I6 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Polr2mQ6P6I6 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Polr2mQ6P6I6 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Polr2mQ6P6I6 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Polr2mQ6P6I6 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Polr2mQ6P6I6 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Polr2mQ6P6I6 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Polr2mQ6P6I6 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Polr2mQ6P6I6 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Polr2mQ6P6I6 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Polr2mQ6P6I6 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Polr2mQ6P6I6 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Polr2mQ6P6I6 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Polr2mQ6P6I6 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Polr2mQ6P6I6 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Polr2mQ6P6I6 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Polr2mQ6P6I6 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Polr2mQ6P6I6 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms