Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZK8

Ptpdc1, Protein tyrosine phosphatase domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpdc1Q6NZK8 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ptpdc1Q6NZK8 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ptpdc1Q6NZK8 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ptpdc1Q6NZK8 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ptpdc1Q6NZK8 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ptpdc1Q6NZK8 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ptpdc1Q6NZK8 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
Ptpdc1Q6NZK8 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ptpdc1Q6NZK8 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
Ptpdc1Q6NZK8 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
Ptpdc1Q6NZK8 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
Ptpdc1Q6NZK8 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ptpdc1Q6NZK8 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ptpdc1Q6NZK8 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ptpdc1Q6NZK8 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ptpdc1Q6NZK8 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ptpdc1Q6NZK8 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ptpdc1Q6NZK8 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ptpdc1Q6NZK8 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ptpdc1Q6NZK8 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ptpdc1Q6NZK8 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ptpdc1Q6NZK8 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Ptpdc1Q6NZK8 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ptpdc1Q6NZK8 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ptpdc1Q6NZK8 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ptpdc1Q6NZK8 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ptpdc1Q6NZK8 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ptpdc1Q6NZK8 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Ptpdc1Q6NZK8 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ptpdc1Q6NZK8 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ptpdc1Q6NZK8 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ptpdc1Q6NZK8 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ptpdc1Q6NZK8 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ptpdc1Q6NZK8 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Ptpdc1Q6NZK8 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Ptpdc1Q6NZK8 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Ptpdc1Q6NZK8 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Ptpdc1Q6NZK8 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ptpdc1Q6NZK8 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ptpdc1Q6NZK8 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ptpdc1Q6NZK8 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ptpdc1Q6NZK8 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ptpdc1Q6NZK8 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ptpdc1Q6NZK8 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ptpdc1Q6NZK8 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ptpdc1Q6NZK8 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ptpdc1Q6NZK8 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ptpdc1Q6NZK8 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ptpdc1Q6NZK8 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ptpdc1Q6NZK8 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ptpdc1Q6NZK8 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ptpdc1Q6NZK8 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ptpdc1Q6NZK8 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ptpdc1Q6NZK8 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ptpdc1Q6NZK8 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ptpdc1Q6NZK8 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ptpdc1Q6NZK8 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
Ptpdc1Q6NZK8 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ptpdc1Q6NZK8 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Ptpdc1Q6NZK8 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Ptpdc1Q6NZK8 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Ptpdc1Q6NZK8 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Ptpdc1Q6NZK8 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ptpdc1Q6NZK8 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ptpdc1Q6NZK8 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Ptpdc1Q6NZK8 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Ptpdc1Q6NZK8 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Ptpdc1Q6NZK8 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.54■■■□□ 2
Ptpdc1Q6NZK8 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Ptpdc1Q6NZK8 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Ptpdc1Q6NZK8 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Ptpdc1Q6NZK8 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Ptpdc1Q6NZK8 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ptpdc1Q6NZK8 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Ptpdc1Q6NZK8 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Ptpdc1Q6NZK8 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
Ptpdc1Q6NZK8 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
Ptpdc1Q6NZK8 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Ptpdc1Q6NZK8 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Ptpdc1Q6NZK8 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ptpdc1Q6NZK8 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ptpdc1Q6NZK8 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Ptpdc1Q6NZK8 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ptpdc1Q6NZK8 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ptpdc1Q6NZK8 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ptpdc1Q6NZK8 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ptpdc1Q6NZK8 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ptpdc1Q6NZK8 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ptpdc1Q6NZK8 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ptpdc1Q6NZK8 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ptpdc1Q6NZK8 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ptpdc1Q6NZK8 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ptpdc1Q6NZK8 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Ptpdc1Q6NZK8 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ptpdc1Q6NZK8 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ptpdc1Q6NZK8 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ptpdc1Q6NZK8 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ptpdc1Q6NZK8 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ptpdc1Q6NZK8 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ptpdc1Q6NZK8 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms