Protein–RNA interactions for Protein: Q6JVL5

Lcn12, Epididymal-specific lipocalin-12, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lcn12Q6JVL5 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Lcn12Q6JVL5 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Lcn12Q6JVL5 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Lcn12Q6JVL5 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Lcn12Q6JVL5 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Lcn12Q6JVL5 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Lcn12Q6JVL5 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Lcn12Q6JVL5 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Lcn12Q6JVL5 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Lcn12Q6JVL5 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Lcn12Q6JVL5 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Lcn12Q6JVL5 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Lcn12Q6JVL5 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Lcn12Q6JVL5 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Lcn12Q6JVL5 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Lcn12Q6JVL5 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Lcn12Q6JVL5 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Lcn12Q6JVL5 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Lcn12Q6JVL5 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Lcn12Q6JVL5 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Lcn12Q6JVL5 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Lcn12Q6JVL5 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Lcn12Q6JVL5 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Lcn12Q6JVL5 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Lcn12Q6JVL5 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Lcn12Q6JVL5 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Lcn12Q6JVL5 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Lcn12Q6JVL5 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Lcn12Q6JVL5 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Lcn12Q6JVL5 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Lcn12Q6JVL5 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Lcn12Q6JVL5 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Lcn12Q6JVL5 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Lcn12Q6JVL5 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Lcn12Q6JVL5 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Lcn12Q6JVL5 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Lcn12Q6JVL5 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Lcn12Q6JVL5 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Lcn12Q6JVL5 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Lcn12Q6JVL5 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Lcn12Q6JVL5 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Lcn12Q6JVL5 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Lcn12Q6JVL5 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Lcn12Q6JVL5 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Lcn12Q6JVL5 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Lcn12Q6JVL5 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Lcn12Q6JVL5 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Lcn12Q6JVL5 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Lcn12Q6JVL5 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Lcn12Q6JVL5 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Lcn12Q6JVL5 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Lcn12Q6JVL5 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Lcn12Q6JVL5 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Lcn12Q6JVL5 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Lcn12Q6JVL5 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Lcn12Q6JVL5 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Lcn12Q6JVL5 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Lcn12Q6JVL5 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Lcn12Q6JVL5 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Lcn12Q6JVL5 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Lcn12Q6JVL5 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Lcn12Q6JVL5 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Lcn12Q6JVL5 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Lcn12Q6JVL5 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Lcn12Q6JVL5 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Lcn12Q6JVL5 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Lcn12Q6JVL5 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Lcn12Q6JVL5 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Lcn12Q6JVL5 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Lcn12Q6JVL5 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Lcn12Q6JVL5 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Lcn12Q6JVL5 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Lcn12Q6JVL5 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Lcn12Q6JVL5 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Lcn12Q6JVL5 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Lcn12Q6JVL5 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Lcn12Q6JVL5 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Lcn12Q6JVL5 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Lcn12Q6JVL5 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Lcn12Q6JVL5 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Lcn12Q6JVL5 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Lcn12Q6JVL5 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Lcn12Q6JVL5 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Lcn12Q6JVL5 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Lcn12Q6JVL5 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Lcn12Q6JVL5 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Lcn12Q6JVL5 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Lcn12Q6JVL5 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Lcn12Q6JVL5 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Lcn12Q6JVL5 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Lcn12Q6JVL5 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Lcn12Q6JVL5 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Lcn12Q6JVL5 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Lcn12Q6JVL5 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Lcn12Q6JVL5 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Lcn12Q6JVL5 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Lcn12Q6JVL5 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Lcn12Q6JVL5 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Lcn12Q6JVL5 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Lcn12Q6JVL5 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms